More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3454 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  100 
 
 
382 aa  722    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  68.55 
 
 
375 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  66.85 
 
 
388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  67.29 
 
 
382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  65.65 
 
 
390 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  66.85 
 
 
374 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  66.48 
 
 
383 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  67.04 
 
 
385 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  65.23 
 
 
371 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  66.85 
 
 
374 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  64.61 
 
 
373 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  64.92 
 
 
379 aa  408  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  58.47 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  65.23 
 
 
369 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  65.08 
 
 
385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  63.03 
 
 
372 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  64.17 
 
 
388 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  65.23 
 
 
371 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  64.38 
 
 
371 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  59.49 
 
 
393 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  56.43 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  59.09 
 
 
401 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  59.19 
 
 
419 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  54.26 
 
 
381 aa  366  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  58.76 
 
 
372 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  58.67 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  64.99 
 
 
376 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  53.68 
 
 
381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  56.76 
 
 
371 aa  325  6e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  53.39 
 
 
366 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  53.7 
 
 
370 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  53.74 
 
 
377 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  53.74 
 
 
377 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  53.74 
 
 
377 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  55.01 
 
 
376 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  55.01 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  46.95 
 
 
373 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
372 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  48.4 
 
 
383 aa  285  8e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  43.67 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 
367 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  45.53 
 
 
367 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.33 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  46.36 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  44.82 
 
 
378 aa  272  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  46.45 
 
 
377 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  43.24 
 
 
374 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  44.74 
 
 
376 aa  269  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.41 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
369 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
369 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
369 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  43.88 
 
 
376 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  41.98 
 
 
373 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  45.74 
 
 
376 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  45.74 
 
 
376 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.53 
 
 
374 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
373 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  44.44 
 
 
375 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  42.78 
 
 
387 aa  258  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  46.15 
 
 
385 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
372 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.54 
 
 
376 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
372 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  40.97 
 
 
373 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  43.84 
 
 
393 aa  256  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.65 
 
 
374 aa  255  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  42.82 
 
 
374 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  47.01 
 
 
377 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  43.51 
 
 
373 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  42.28 
 
 
369 aa  252  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  40.93 
 
 
376 aa  250  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  40.69 
 
 
392 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  41.53 
 
 
374 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.5 
 
 
371 aa  249  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  38.81 
 
 
371 aa  248  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.53 
 
 
390 aa  248  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  38.17 
 
 
388 aa  248  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  40.47 
 
 
376 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  43.6 
 
 
366 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  46.63 
 
 
383 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  46.63 
 
 
383 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  44.3 
 
 
378 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  46.37 
 
 
379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.17 
 
 
368 aa  245  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.92 
 
 
372 aa  245  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  42.51 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  39.35 
 
 
373 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
372 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  40.21 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
372 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  38.54 
 
 
367 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  41.13 
 
 
367 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36 
 
 
373 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
372 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  41.96 
 
 
372 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  43.43 
 
 
374 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
372 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  39.53 
 
 
373 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>