More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1476 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  100 
 
 
377 aa  713    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  69.27 
 
 
371 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
366 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  65.3 
 
 
370 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  65.3 
 
 
377 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  65.3 
 
 
377 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  65.3 
 
 
377 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  64.74 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  59.78 
 
 
372 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  66.57 
 
 
376 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  56.03 
 
 
375 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  56.01 
 
 
373 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  56.32 
 
 
374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  54.93 
 
 
390 aa  345  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  53.23 
 
 
412 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  57.26 
 
 
374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  51.87 
 
 
388 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  55.28 
 
 
385 aa  331  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  53.53 
 
 
382 aa  330  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  54.5 
 
 
369 aa  329  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  56.03 
 
 
388 aa  329  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  51.78 
 
 
393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 
371 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  52.62 
 
 
383 aa  316  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  54.5 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  53.41 
 
 
401 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  53.54 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  51.78 
 
 
372 aa  300  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  51.31 
 
 
393 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  55.01 
 
 
382 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
371 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  47.4 
 
 
381 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  51.45 
 
 
419 aa  279  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  47.3 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  46.03 
 
 
381 aa  273  3e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  51.9 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.71 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  38.5 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.71 
 
 
372 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  42.82 
 
 
368 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  42.42 
 
 
367 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  38.84 
 
 
369 aa  249  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
373 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  38.74 
 
 
373 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
373 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  41.48 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  39.35 
 
 
378 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  41.78 
 
 
374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  39.73 
 
 
376 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  40.5 
 
 
369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  40.5 
 
 
369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  40.05 
 
 
382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  34.71 
 
 
373 aa  235  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  38.4 
 
 
390 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  39.41 
 
 
375 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  39.83 
 
 
392 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  39.35 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  42.08 
 
 
374 aa  232  6e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  41.26 
 
 
369 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  40.64 
 
 
371 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.48 
 
 
383 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  40.65 
 
 
374 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  41.03 
 
 
393 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  41.8 
 
 
376 aa  230  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  41.98 
 
 
372 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  41.98 
 
 
372 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  42.42 
 
 
376 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  42.42 
 
 
376 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
373 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  41.98 
 
 
372 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  42.25 
 
 
372 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  40.36 
 
 
366 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  38.8 
 
 
373 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  41.82 
 
 
372 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  41.08 
 
 
379 aa  226  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  41.82 
 
 
372 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  33.96 
 
 
373 aa  225  8e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  41.11 
 
 
375 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  38.48 
 
 
376 aa  225  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  37.84 
 
 
384 aa  225  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  38.98 
 
 
372 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  39.16 
 
 
390 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  42.63 
 
 
390 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  42.34 
 
 
377 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 
373 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  38.92 
 
 
372 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  39.51 
 
 
392 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  38.67 
 
 
374 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  40.11 
 
 
372 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  36.04 
 
 
388 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  38.42 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  38.98 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  36.46 
 
 
371 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  35.81 
 
 
376 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  37.9 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  39.95 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  38.98 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  39.46 
 
 
376 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>