More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4153 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  100 
 
 
374 aa  750    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 
373 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  48.35 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  44.15 
 
 
390 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 
373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.72 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
373 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  43.65 
 
 
373 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.94 
 
 
378 aa  279  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  41.96 
 
 
373 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
373 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  42.51 
 
 
376 aa  276  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
373 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  42.51 
 
 
376 aa  276  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  39.84 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.39 
 
 
372 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  41.21 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  43.49 
 
 
370 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  39.9 
 
 
381 aa  271  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
373 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.23 
 
 
375 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
393 aa  269  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
379 aa  269  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  41.76 
 
 
393 aa  268  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  42.19 
 
 
392 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  43.41 
 
 
372 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
375 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  41.05 
 
 
373 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  40.93 
 
 
372 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  40.93 
 
 
372 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  40.93 
 
 
372 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  41.73 
 
 
383 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  40.93 
 
 
372 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
373 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 
371 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 
392 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 
378 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 
372 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  40.53 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
374 aa  262  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  42.78 
 
 
379 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
375 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
374 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  42.23 
 
 
372 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  43.02 
 
 
373 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  42.63 
 
 
383 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  41.07 
 
 
376 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  41.76 
 
 
374 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
373 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  41.14 
 
 
389 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  40.32 
 
 
387 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
372 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
372 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
372 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  42.78 
 
 
383 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  40.27 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 
406 aa  259  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  41.32 
 
 
374 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  40.93 
 
 
372 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  40.93 
 
 
372 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  40.93 
 
 
379 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  42.82 
 
 
379 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  41.32 
 
 
376 aa  256  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  42.58 
 
 
372 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  40.79 
 
 
385 aa  256  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
372 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  41.58 
 
 
390 aa  255  9e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  42.62 
 
 
377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  41.73 
 
 
377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  40.37 
 
 
376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  40.05 
 
 
381 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
372 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  40.87 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  40.38 
 
 
378 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  40.11 
 
 
369 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
372 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 
372 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  41.33 
 
 
366 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.08 
 
 
378 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 
372 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 
372 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  40.38 
 
 
372 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  39.73 
 
 
379 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  40.6 
 
 
393 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  37.16 
 
 
388 aa  249  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 
372 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  42.58 
 
 
372 aa  249  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
372 aa  249  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
383 aa  249  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  39.41 
 
 
377 aa  248  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
372 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
372 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  39.56 
 
 
379 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>