More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1538 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  100 
 
 		 393 aa  793    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.23 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  44.24 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.38 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  42.74 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  44.89 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.23 
 
 		 373 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  42.32 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 374 aa  296  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.96 
 
 		 376 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 375 aa  292  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.41 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.57 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.98 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 		 372 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  41.8 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 		 374 aa  286  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.12 
 
 		 378 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  40.75 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  42.01 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  42.01 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.48 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  42.2 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 		 372 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 		 372 aa  278  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  41.4 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  43.51 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 		 373 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  39.73 
 
 		 384 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  43.99 
 
 		 376 aa  276  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  41.33 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 374 aa  275  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  41.83 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  39.3 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  41.95 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  39.94 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  41.35 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  43.43 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  43.44 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  43.05 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  47.95 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 372 aa  272  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  42.08 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  40.59 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  41.26 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  43.33 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  45.75 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  42.55 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  42.5 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  41.3 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  44.63 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 		 379 aa  269  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  46.21 
 
 		 385 aa  268  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  41.76 
 
 		 374 aa  268  8.999999999999999e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  41.64 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  41.64 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  41.64 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  41.99 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  41.37 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  41.32 
 
 		 372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  45.11 
 
 		 374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  40.65 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  39.94 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  41.82 
 
 		 380 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  39.21 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  42.2 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  45.08 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  39.46 
 
 		 379 aa  264  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  40.82 
 
 		 373 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  41.21 
 
 		 370 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 		 379 aa  262  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>