More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3457 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
390 aa  752    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  73.7 
 
 
378 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  73.7 
 
 
378 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  73.22 
 
 
378 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  69.95 
 
 
389 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  69.41 
 
 
389 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  66.84 
 
 
392 aa  494  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  68.19 
 
 
393 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  64.38 
 
 
379 aa  479  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  63.96 
 
 
373 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  64.23 
 
 
373 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  63.11 
 
 
386 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  63.76 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  63.49 
 
 
371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  63.3 
 
 
379 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  63.83 
 
 
376 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  63.69 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  63.34 
 
 
376 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 
387 aa  434  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 
379 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  63.24 
 
 
385 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  61.79 
 
 
396 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  60.7 
 
 
377 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  60.7 
 
 
377 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  62.8 
 
 
376 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  60.81 
 
 
382 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  63.34 
 
 
376 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  58.08 
 
 
370 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  60.33 
 
 
383 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  56.13 
 
 
368 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  55.89 
 
 
374 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  55.07 
 
 
370 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  55.59 
 
 
375 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  55.07 
 
 
374 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  58.58 
 
 
368 aa  359  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  55.59 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  55.73 
 
 
377 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  52.62 
 
 
380 aa  322  9.000000000000001e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  50 
 
 
373 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 
372 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 
372 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  48.64 
 
 
374 aa  299  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  51.37 
 
 
377 aa  298  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 
371 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  46.47 
 
 
375 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
376 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  45.53 
 
 
373 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  42.54 
 
 
372 aa  288  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 
372 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
368 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 
372 aa  285  9e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.09 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
376 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
373 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.67 
 
 
378 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 
374 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 
390 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
374 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 
372 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
372 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 
372 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
374 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
372 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 
372 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  44.77 
 
 
376 aa  275  8e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
373 aa  275  9e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  45.11 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.84 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
372 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
373 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  43.87 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  44.89 
 
 
374 aa  272  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
372 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  42.86 
 
 
387 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.8 
 
 
374 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  42.55 
 
 
393 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  44.9 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  43.43 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.69 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
378 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.5 
 
 
374 aa  269  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  43.96 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  41.8 
 
 
370 aa  269  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 
367 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
372 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>