More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1146 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
377 aa  734    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  61.21 
 
 
380 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  60.54 
 
 
368 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  52.59 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  52.07 
 
 
379 aa  336  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  56.47 
 
 
383 aa  335  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  52.69 
 
 
392 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  51.93 
 
 
393 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  51.38 
 
 
389 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  54.7 
 
 
368 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  53.02 
 
 
374 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  53.17 
 
 
379 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  52.62 
 
 
386 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  50.55 
 
 
389 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  52.59 
 
 
374 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  52.59 
 
 
370 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  51.52 
 
 
378 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  51.37 
 
 
390 aa  325  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  52.07 
 
 
377 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  52.86 
 
 
382 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  52.16 
 
 
378 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  50.27 
 
 
385 aa  322  9.000000000000001e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  54.01 
 
 
368 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  51.62 
 
 
378 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  51.62 
 
 
378 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  52.76 
 
 
370 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  46.92 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  52.91 
 
 
375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  50.55 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  50.96 
 
 
387 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  50.55 
 
 
371 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  50.82 
 
 
373 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  51.52 
 
 
376 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  50.96 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
396 aa  299  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
377 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
377 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  46.74 
 
 
373 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.17 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  47.7 
 
 
377 aa  269  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  51.35 
 
 
377 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 
373 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 
376 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.53 
 
 
371 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.73 
 
 
372 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
372 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
372 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  42.55 
 
 
378 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  44.77 
 
 
372 aa  262  6.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 
372 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  41.58 
 
 
373 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  47.12 
 
 
377 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.64 
 
 
390 aa  258  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
372 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 
368 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.97 
 
 
376 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.89 
 
 
390 aa  256  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
372 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  41.08 
 
 
387 aa  255  9e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.26 
 
 
375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.53 
 
 
378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  42.82 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 
363 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
370 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  38.75 
 
 
406 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.55 
 
 
383 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
374 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  41.37 
 
 
365 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  43.41 
 
 
378 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 
378 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  44.17 
 
 
379 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 
375 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  42.82 
 
 
373 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
374 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
394 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 
376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  44.65 
 
 
374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
378 aa  245  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 
367 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  44.93 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>