More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2457 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  100 
 
 
374 aa  730    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  84.55 
 
 
374 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  70.19 
 
 
375 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  77.72 
 
 
388 aa  485  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  68.83 
 
 
388 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  65.41 
 
 
382 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  68.21 
 
 
369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  68.75 
 
 
385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  66.76 
 
 
385 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  63.61 
 
 
371 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  60.98 
 
 
372 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  62.76 
 
 
393 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  60.17 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  61.41 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  66.31 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  62.43 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  62.23 
 
 
371 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  61.28 
 
 
383 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  61.67 
 
 
419 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  56.68 
 
 
393 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  61.46 
 
 
373 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  58.62 
 
 
412 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  61.04 
 
 
379 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  53.8 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  52.43 
 
 
381 aa  366  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  62.15 
 
 
376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  55.5 
 
 
401 aa  355  5e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  55.46 
 
 
366 aa  349  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  55.91 
 
 
371 aa  342  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  51.89 
 
 
381 aa  342  5e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  56.32 
 
 
377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  53.53 
 
 
377 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  53.53 
 
 
377 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  53.53 
 
 
377 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  53.8 
 
 
370 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  55.89 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  47.53 
 
 
367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
372 aa  305  7e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  46.58 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  46.58 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  46.58 
 
 
367 aa  301  9e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
378 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 
369 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  43.96 
 
 
373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  43.87 
 
 
376 aa  282  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  43.92 
 
 
387 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  46.65 
 
 
374 aa  278  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 
372 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.15 
 
 
373 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
372 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 
373 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.77 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  41.67 
 
 
371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  41.96 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  38.5 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.26 
 
 
371 aa  272  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.09 
 
 
390 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  42.23 
 
 
373 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  40.82 
 
 
376 aa  269  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  45.16 
 
 
382 aa  267  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.92 
 
 
374 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  46.15 
 
 
377 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
368 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  41.69 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
390 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  40.38 
 
 
369 aa  265  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 
373 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  44.71 
 
 
379 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  44.71 
 
 
383 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  45 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  45.01 
 
 
372 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
374 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  44.71 
 
 
383 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
376 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  44.74 
 
 
372 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  43.67 
 
 
376 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  43.67 
 
 
376 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  39.41 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 
374 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  43.09 
 
 
366 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 
378 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  43.85 
 
 
374 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  43.95 
 
 
377 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
372 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  40.11 
 
 
374 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  39.73 
 
 
375 aa  255  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  45.07 
 
 
378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  40.43 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  40.69 
 
 
376 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  43.7 
 
 
372 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  43.94 
 
 
372 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  43.94 
 
 
372 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
393 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  42.58 
 
 
367 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>