More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2062 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  100 
 
 
371 aa  711    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  70.62 
 
 
370 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  70.57 
 
 
377 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  70.57 
 
 
377 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  69.81 
 
 
366 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  70.57 
 
 
377 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  70 
 
 
376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  69.27 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  62.63 
 
 
372 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  56.17 
 
 
412 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  64.61 
 
 
376 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  55.32 
 
 
375 aa  361  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  55.91 
 
 
374 aa  352  8e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  54.19 
 
 
390 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  54.59 
 
 
373 aa  345  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  52.13 
 
 
388 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  54.81 
 
 
369 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  54.93 
 
 
385 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  54.93 
 
 
374 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  52.69 
 
 
382 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  51.08 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  54.96 
 
 
388 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  52.3 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  56.5 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  50.8 
 
 
371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  51.69 
 
 
383 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  51.08 
 
 
401 aa  305  9.000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  49.33 
 
 
371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  50.8 
 
 
371 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  51.39 
 
 
385 aa  295  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  53.21 
 
 
379 aa  295  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  47.49 
 
 
377 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  50.51 
 
 
393 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  46.38 
 
 
381 aa  290  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  46.77 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  50.14 
 
 
419 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  43.85 
 
 
373 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  38.87 
 
 
373 aa  262  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  42.02 
 
 
378 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  43.16 
 
 
374 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.85 
 
 
368 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.36 
 
 
372 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 
372 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  39.52 
 
 
373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.36 
 
 
372 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  41.58 
 
 
367 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  42.39 
 
 
372 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
379 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  43.54 
 
 
390 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  39.4 
 
 
376 aa  249  7e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  37.16 
 
 
369 aa  249  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 
372 aa  247  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  42.66 
 
 
376 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  42.32 
 
 
389 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  40.05 
 
 
372 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  41.03 
 
 
374 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
374 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  41.64 
 
 
393 aa  246  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  42.32 
 
 
389 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  42.03 
 
 
383 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  41.29 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  40.65 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.39 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  42.67 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  42.37 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  42.05 
 
 
382 aa  243  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  42.05 
 
 
369 aa  243  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 
376 aa  242  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 
390 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  38.59 
 
 
367 aa  242  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  41.78 
 
 
374 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  41.4 
 
 
373 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  40.49 
 
 
372 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  40.49 
 
 
372 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  40.49 
 
 
372 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  40.49 
 
 
372 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  36.16 
 
 
372 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  43.57 
 
 
372 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  40.79 
 
 
375 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  39.78 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  36.22 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  39.84 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  41.69 
 
 
377 aa  240  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  39.73 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  39.63 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  39.68 
 
 
373 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  42.4 
 
 
374 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
372 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  39.57 
 
 
384 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  39.89 
 
 
372 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  40.65 
 
 
379 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  40.32 
 
 
372 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  34.67 
 
 
373 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  39.26 
 
 
372 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  37.53 
 
 
387 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  43.86 
 
 
372 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  38.48 
 
 
374 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  40.59 
 
 
373 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  34.66 
 
 
373 aa  236  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>