More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1190 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  100 
 
 
376 aa  710    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  73.37 
 
 
372 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  67.47 
 
 
412 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  62.8 
 
 
375 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  61.68 
 
 
374 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  59.57 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  62.15 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  62.03 
 
 
374 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  63.81 
 
 
371 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  62.02 
 
 
382 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  65.38 
 
 
377 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  62.02 
 
 
366 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  63.78 
 
 
385 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  63.04 
 
 
369 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  64.32 
 
 
376 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  61.08 
 
 
370 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  58.79 
 
 
390 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  62.5 
 
 
371 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  61.58 
 
 
372 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  61.25 
 
 
377 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  61.25 
 
 
377 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  61.41 
 
 
371 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  61.25 
 
 
377 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  62.77 
 
 
371 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  65.23 
 
 
382 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  55.74 
 
 
393 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  59.43 
 
 
383 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  60.98 
 
 
388 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  55.88 
 
 
401 aa  363  4e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  59.15 
 
 
385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  56.04 
 
 
393 aa  352  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  60.22 
 
 
379 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  58.5 
 
 
419 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  50.4 
 
 
377 aa  322  9.000000000000001e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  50.95 
 
 
381 aa  321  9.999999999999999e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  51.76 
 
 
381 aa  318  9e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
369 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
369 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  43.92 
 
 
367 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  35.85 
 
 
373 aa  268  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  45.71 
 
 
383 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  41.86 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  43.24 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 
367 aa  265  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.29 
 
 
372 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 
378 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 
374 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  44.57 
 
 
382 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  41.05 
 
 
373 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 
369 aa  262  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  41.82 
 
 
384 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  40.61 
 
 
369 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  43.54 
 
 
375 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  41.92 
 
 
374 aa  256  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  44.3 
 
 
393 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
376 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.24 
 
 
372 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  36.86 
 
 
373 aa  255  7e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  38.27 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  44.69 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.24 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  40.05 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  46.08 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  45.05 
 
 
366 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 
363 aa  252  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  43.88 
 
 
375 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  39.3 
 
 
373 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.67 
 
 
368 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  40.98 
 
 
373 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  42.67 
 
 
372 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  42.98 
 
 
376 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 
372 aa  248  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  44.14 
 
 
376 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  44.14 
 
 
376 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
374 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  38.67 
 
 
392 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
372 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  41.08 
 
 
379 aa  246  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  42.15 
 
 
376 aa  245  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  40.53 
 
 
372 aa  245  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  43.41 
 
 
372 aa  245  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  43.78 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  43.78 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  41.02 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 
372 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 
372 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  42.13 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
372 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
372 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
372 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
372 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  43.78 
 
 
372 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  39.51 
 
 
367 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  45.03 
 
 
390 aa  242  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 
372 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  42.13 
 
 
372 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  41.78 
 
 
373 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  42.7 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>