More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3064 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  95.19 
 
 		 374 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 374 aa  738    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  99.2 
 
 		 374 aa  731    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  86.02 
 
 		 372 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  85.75 
 
 		 372 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  82.26 
 
 		 372 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  82.8 
 
 		 372 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  83.33 
 
 		 372 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  82.8 
 
 		 372 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  82.53 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  82.53 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  82.8 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  82.8 
 
 		 372 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  82.53 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  82.8 
 
 		 372 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  82.53 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  82.53 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  82.53 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  82.8 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  82.8 
 
 		 372 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  82.53 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  81.72 
 
 		 372 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  81.99 
 
 		 372 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  70.7 
 
 		 372 aa  543  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  72.4 
 
 		 379 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  71.35 
 
 		 378 aa  528  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  72.83 
 
 		 378 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  71.93 
 
 		 372 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  71.28 
 
 		 382 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  73.35 
 
 		 372 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  72.31 
 
 		 372 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  72.43 
 
 		 374 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  69.02 
 
 		 378 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  68.01 
 
 		 372 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  71.54 
 
 		 380 aa  510  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  71.28 
 
 		 380 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  71.24 
 
 		 380 aa  504  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  67.57 
 
 		 371 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  70.13 
 
 		 379 aa  488  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  62.74 
 
 		 368 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  61.14 
 
 		 372 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  61.14 
 
 		 372 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  59.89 
 
 		 374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  59.07 
 
 		 376 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  61.14 
 
 		 375 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  59.45 
 
 		 390 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  61.92 
 
 		 378 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  58.36 
 
 		 376 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  61.41 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  59.95 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  59.95 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  59.89 
 
 		 375 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  59.68 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  59.95 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  59.63 
 
 		 374 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  59.14 
 
 		 373 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  57.75 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  63.01 
 
 		 374 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  59.14 
 
 		 372 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  58.87 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  56.59 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  60.5 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  56.32 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  56.32 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  70.36 
 
 		 260 aa  355  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  71.71 
 
 		 260 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  48.24 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  48.92 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  51.65 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 		 376 aa  338  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  47.7 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  49.46 
 
 		 393 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  47.37 
 
 		 370 aa  326  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  48.64 
 
 		 373 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  47.55 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  49.32 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  47.83 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 		 367 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  47.7 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 		 373 aa  316  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  42.78 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  48.09 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  46.49 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 		 378 aa  310  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 		 372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  49.33 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  47.54 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  51.45 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  51.73 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 372 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 		 373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  45.8 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>