More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  100 
 
 
372 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  73.37 
 
 
376 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  62.3 
 
 
412 aa  418  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  60.32 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  61.41 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  62.63 
 
 
371 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  61.1 
 
 
366 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  56.72 
 
 
388 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  60 
 
 
377 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  59.68 
 
 
374 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  59.08 
 
 
370 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  60 
 
 
377 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  60 
 
 
377 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  57.26 
 
 
373 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  61.1 
 
 
376 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  59.78 
 
 
377 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  59.62 
 
 
369 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  55.14 
 
 
382 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  59.03 
 
 
385 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  53.15 
 
 
393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  55.4 
 
 
390 aa  355  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  57.61 
 
 
371 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  58.51 
 
 
379 aa  352  7e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  55.8 
 
 
371 aa  351  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  55.74 
 
 
372 aa  350  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  56.25 
 
 
371 aa  350  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  54.38 
 
 
393 aa  345  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  57.95 
 
 
388 aa  343  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  55.43 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  58.49 
 
 
382 aa  335  5.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  54.37 
 
 
385 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  55 
 
 
419 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  52.57 
 
 
401 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  49.45 
 
 
381 aa  323  3e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  48.51 
 
 
377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  48.37 
 
 
381 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.73 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  37.37 
 
 
373 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  39.56 
 
 
369 aa  266  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
367 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
373 aa  262  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  41.22 
 
 
378 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  37.67 
 
 
373 aa  259  4e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
369 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
369 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  40.37 
 
 
387 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
367 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  39.73 
 
 
376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  41.53 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.65 
 
 
374 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  42.47 
 
 
376 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  41.38 
 
 
375 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  41.6 
 
 
390 aa  249  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  43.17 
 
 
393 aa  249  6e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  38.25 
 
 
374 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
374 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  39.19 
 
 
373 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  41.53 
 
 
368 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  41.91 
 
 
371 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  42.23 
 
 
385 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  38.75 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  37.74 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  40.88 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  39.95 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  38.59 
 
 
373 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
373 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  40.94 
 
 
375 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  41.11 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
372 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  42.16 
 
 
379 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  44.81 
 
 
374 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  37.91 
 
 
367 aa  239  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
370 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  41.53 
 
 
383 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
374 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  37.5 
 
 
371 aa  238  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  41.53 
 
 
383 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  38.52 
 
 
369 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  40.54 
 
 
376 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  39.94 
 
 
374 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  37.64 
 
 
414 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  41.6 
 
 
379 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  40.53 
 
 
372 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  42.08 
 
 
390 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  37.36 
 
 
367 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  42.08 
 
 
374 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  40.38 
 
 
373 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  37.36 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  37.64 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  37.36 
 
 
367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  37.91 
 
 
367 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  38.27 
 
 
392 aa  236  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  40.64 
 
 
393 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  38.8 
 
 
374 aa  235  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  36.66 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>