More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1223 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 371 aa  711    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  85.18 
 
 		 371 aa  566  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  65.41 
 
 		 375 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  63.07 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  64.23 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  64.23 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  65.04 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  60.7 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  62.33 
 
 		 374 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  61.79 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  61.89 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  62.97 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  60.62 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  60.39 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  64.46 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  56.18 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  57.61 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  59.78 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  56.98 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  59.72 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  57.81 
 
 		 401 aa  358  9e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  62.15 
 
 		 376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  56.79 
 
 		 419 aa  350  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  52.85 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  55.56 
 
 		 412 aa  338  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  57.34 
 
 		 379 aa  336  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  52.97 
 
 		 377 aa  335  7e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  54.37 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 		 377 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 		 377 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 		 377 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  54.77 
 
 		 376 aa  322  7e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  54.5 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  51.63 
 
 		 381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  52.97 
 
 		 370 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  50.8 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  46.9 
 
 		 373 aa  298  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  45.84 
 
 		 378 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  49.73 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  49.73 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.94 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  49.2 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  49.2 
 
 		 372 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  41.26 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.36 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 375 aa  276  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 		 373 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  44.47 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  42.36 
 
 		 373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.68 
 
 		 368 aa  271  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  42.15 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  42.15 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.92 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  38.25 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  39.73 
 
 		 371 aa  269  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  45.36 
 
 		 376 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  42.09 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  43.28 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  40.75 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  45.72 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  45.72 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  39.78 
 
 		 373 aa  266  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  44.92 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  41.82 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.72 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  44.65 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  47.71 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  42.12 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.35 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  43.85 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  46.63 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  46.63 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  46.36 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.24 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.39 
 
 		 374 aa  258  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 373 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  44.48 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  45.38 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  48.08 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  44.65 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  41.85 
 
 		 393 aa  255  8e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  41.35 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  42.25 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  39.62 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.26 
 
 		 376 aa  252  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 		 374 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  41.73 
 
 		 376 aa  252  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>