More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1591 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  100 
 
 
373 aa  717    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  62.63 
 
 
375 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  64.23 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  61.93 
 
 
382 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  60.59 
 
 
388 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  65.31 
 
 
385 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  62.82 
 
 
390 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  56.72 
 
 
393 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  60.05 
 
 
372 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 
371 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  61.46 
 
 
374 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  62.43 
 
 
374 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  61.79 
 
 
371 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  62.29 
 
 
383 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  60.65 
 
 
371 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  57.26 
 
 
372 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  64.61 
 
 
382 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  61.83 
 
 
388 aa  362  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  62.07 
 
 
376 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  56.59 
 
 
366 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  57.62 
 
 
419 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  55.43 
 
 
370 aa  351  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  57.46 
 
 
385 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  54.96 
 
 
412 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  54.62 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  54.62 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  54.62 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  56.19 
 
 
393 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  55.74 
 
 
377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  58.11 
 
 
379 aa  335  9e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  54.05 
 
 
371 aa  335  9e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  52.16 
 
 
381 aa  333  2e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  56.71 
 
 
376 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  53.91 
 
 
401 aa  328  9e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  51.21 
 
 
381 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
377 aa  318  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  47.86 
 
 
373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 
367 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 
373 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 
369 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
376 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
373 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  43.41 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.3 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  46.13 
 
 
372 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44 
 
 
374 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  44.95 
 
 
372 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.94 
 
 
369 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  46.13 
 
 
372 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  44.95 
 
 
372 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  40.69 
 
 
390 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  44.68 
 
 
372 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.53 
 
 
383 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.18 
 
 
390 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  41.64 
 
 
375 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  46.09 
 
 
376 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  46.09 
 
 
376 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  43.16 
 
 
372 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  42.35 
 
 
369 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  47.51 
 
 
363 aa  262  6e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  42.42 
 
 
369 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  42.42 
 
 
369 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  44.78 
 
 
377 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  45.16 
 
 
374 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.65 
 
 
375 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  43.43 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  47.81 
 
 
386 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.86 
 
 
376 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  40.7 
 
 
371 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  41.18 
 
 
374 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  40.91 
 
 
373 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  43.01 
 
 
376 aa  255  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  42.86 
 
 
382 aa  256  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  42.9 
 
 
366 aa  255  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  43.87 
 
 
372 aa  255  9e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  42.67 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  43.73 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  44.8 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  45.38 
 
 
379 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  44.65 
 
 
372 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  43.43 
 
 
372 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  43.43 
 
 
372 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  45.38 
 
 
383 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 
372 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  44.57 
 
 
374 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  44.41 
 
 
385 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 
372 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  45.38 
 
 
383 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  44.83 
 
 
376 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
372 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.85 
 
 
368 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  42.2 
 
 
372 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 
372 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  41.19 
 
 
392 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  41.53 
 
 
374 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  43.88 
 
 
374 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  42.02 
 
 
375 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>