More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3377 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  100 
 
 
385 aa  747    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  77.51 
 
 
388 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  66.22 
 
 
375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  66.4 
 
 
374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  64.96 
 
 
382 aa  431  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  65.77 
 
 
374 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  65.85 
 
 
388 aa  421  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  63.42 
 
 
385 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  64.5 
 
 
369 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  63.07 
 
 
371 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  66.94 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  59.89 
 
 
383 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  60 
 
 
372 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  57.1 
 
 
390 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  58.81 
 
 
393 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  51.82 
 
 
393 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  58.22 
 
 
373 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
371 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  58.29 
 
 
419 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  59.62 
 
 
371 aa  362  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  54.74 
 
 
372 aa  353  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  52.01 
 
 
377 aa  350  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  57.99 
 
 
379 aa  342  9e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  53.54 
 
 
401 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  55.29 
 
 
412 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  48.7 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  52.86 
 
 
366 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  59.15 
 
 
376 aa  329  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  49.09 
 
 
381 aa  322  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  52.56 
 
 
370 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  52.56 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  52.56 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  52.56 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  53.51 
 
 
376 aa  316  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  53.95 
 
 
377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  51.6 
 
 
371 aa  298  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.42 
 
 
378 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.34 
 
 
372 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  43.48 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  43.48 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  42.37 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  47.88 
 
 
379 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  47.62 
 
 
383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  47.62 
 
 
383 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  40.87 
 
 
369 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 
367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 
373 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  46.4 
 
 
372 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  46.4 
 
 
372 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.8 
 
 
368 aa  265  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  40.91 
 
 
390 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.34 
 
 
374 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  44.53 
 
 
375 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  45.91 
 
 
377 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.82 
 
 
374 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
374 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  43.49 
 
 
377 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.48 
 
 
369 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  45.31 
 
 
374 aa  260  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
373 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  43.85 
 
 
372 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  40.81 
 
 
373 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  41.3 
 
 
369 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  44.39 
 
 
372 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  44.39 
 
 
372 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  42.93 
 
 
376 aa  255  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  41.92 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  42.43 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  42.93 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 
376 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.99 
 
 
376 aa  252  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  44.39 
 
 
372 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  42.31 
 
 
393 aa  252  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  41.35 
 
 
373 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
373 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  43.32 
 
 
372 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 
372 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  37.33 
 
 
373 aa  249  4e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  43.85 
 
 
375 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.71 
 
 
373 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  38.08 
 
 
367 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.19 
 
 
376 aa  248  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  38.96 
 
 
367 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  40.43 
 
 
382 aa  247  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  39.04 
 
 
376 aa  246  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  44.06 
 
 
378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 
367 aa  245  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  44 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  37.81 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  38.08 
 
 
386 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  38.02 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  38.02 
 
 
386 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  40.97 
 
 
372 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  37.74 
 
 
414 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>