More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0344 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
376 aa  770    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  65.38 
 
 
372 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  65.38 
 
 
372 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  65.11 
 
 
368 aa  481  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  62.47 
 
 
374 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  65.11 
 
 
372 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  64.29 
 
 
372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  63.74 
 
 
372 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  63.74 
 
 
372 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  64.01 
 
 
372 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  63.74 
 
 
372 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  64.01 
 
 
372 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  60.38 
 
 
375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  59.89 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  61.25 
 
 
378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  60.44 
 
 
372 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  57.84 
 
 
374 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  62.64 
 
 
373 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  58.9 
 
 
371 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  59.29 
 
 
372 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  60.82 
 
 
375 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  60.44 
 
 
372 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
372 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  59.73 
 
 
372 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  59.73 
 
 
372 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
372 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  59.41 
 
 
394 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
372 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
372 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  59.62 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
372 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  59.18 
 
 
372 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  59.07 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
372 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
372 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  59.44 
 
 
372 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  59.62 
 
 
372 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  59.62 
 
 
372 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  58.81 
 
 
390 aa  433  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  57.58 
 
 
376 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  59.34 
 
 
372 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  59.34 
 
 
374 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  57.37 
 
 
373 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  56.68 
 
 
376 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  61.37 
 
 
374 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  59.07 
 
 
374 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  61.6 
 
 
380 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  59.07 
 
 
374 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  55.46 
 
 
379 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  53.93 
 
 
378 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  54.03 
 
 
378 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  57.03 
 
 
372 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  54.23 
 
 
382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  56.06 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  53.95 
 
 
376 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  53.95 
 
 
376 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  58.74 
 
 
374 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  52.97 
 
 
378 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  53.89 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  53.48 
 
 
380 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  53.48 
 
 
380 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  54.13 
 
 
379 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.44 
 
 
373 aa  349  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  47.44 
 
 
376 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  47.44 
 
 
373 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 
390 aa  332  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 
405 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  47.71 
 
 
373 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  45.84 
 
 
373 aa  325  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 
390 aa  320  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  45.03 
 
 
372 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  46.26 
 
 
392 aa  319  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 
390 aa  316  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  48.83 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  48.57 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  47.62 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  47.62 
 
 
373 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  44.2 
 
 
376 aa  308  8e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
375 aa  305  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  45.7 
 
 
387 aa  305  7e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  42.63 
 
 
373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
378 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
373 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
367 aa  298  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  58.75 
 
 
260 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 
379 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  58.43 
 
 
260 aa  295  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 
375 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  45.86 
 
 
367 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  44.56 
 
 
376 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  45.41 
 
 
379 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 
376 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
373 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  45.75 
 
 
370 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
384 aa  292  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
389 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  41.03 
 
 
369 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>