More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1221 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  100 
 
 
381 aa  765    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  70.19 
 
 
377 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  57.49 
 
 
372 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  53.53 
 
 
382 aa  364  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  51.77 
 
 
393 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  51.89 
 
 
388 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  53.37 
 
 
375 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  52.43 
 
 
374 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  55.16 
 
 
379 aa  346  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  55.65 
 
 
419 aa  346  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  52.42 
 
 
371 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  52.41 
 
 
374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  52.16 
 
 
369 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  52.7 
 
 
385 aa  329  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  51.55 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  52.16 
 
 
373 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  51.69 
 
 
390 aa  322  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  51.05 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  53.58 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  52.85 
 
 
371 aa  320  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  47.83 
 
 
381 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  51.97 
 
 
383 aa  316  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  49.45 
 
 
372 aa  315  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  50.94 
 
 
401 aa  312  6.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  49.44 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  48.81 
 
 
412 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  49.08 
 
 
371 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 
369 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 
369 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  45.75 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  42.43 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 
366 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  41.8 
 
 
378 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
372 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.99 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  47.3 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  45.43 
 
 
371 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
370 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  43.05 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  43.32 
 
 
376 aa  272  6e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  44.23 
 
 
377 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  44.72 
 
 
366 aa  272  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  51.27 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  40.92 
 
 
373 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
377 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
377 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
377 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  41.78 
 
 
374 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.48 
 
 
383 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
373 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  41.13 
 
 
376 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  42.93 
 
 
383 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  42.93 
 
 
383 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  42.67 
 
 
379 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  42.78 
 
 
385 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  41.27 
 
 
376 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  40.64 
 
 
373 aa  258  9e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  39.46 
 
 
373 aa  257  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
374 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
367 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
373 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  39.24 
 
 
373 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
393 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  39.04 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  42.13 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  41.62 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  39.62 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  40.98 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  38.38 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  40.87 
 
 
373 aa  252  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  39.95 
 
 
379 aa  252  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 
374 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  46.03 
 
 
377 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  36.93 
 
 
373 aa  247  3e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  39.62 
 
 
388 aa  246  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  42.38 
 
 
373 aa  245  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  41.24 
 
 
371 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  42.38 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
370 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
372 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  40.38 
 
 
382 aa  239  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  40.6 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  40.48 
 
 
390 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
367 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  40.27 
 
 
367 aa  238  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
367 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
367 aa  238  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
367 aa  238  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
367 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
367 aa  238  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>