More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0430 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  100 
 
 
385 aa  746    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  47.87 
 
 
390 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
376 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  49.2 
 
 
373 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  47.72 
 
 
373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  50.13 
 
 
377 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  45.7 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 
373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  49.21 
 
 
383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  49.47 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  48.95 
 
 
383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  44.65 
 
 
373 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  41.37 
 
 
372 aa  295  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  49.86 
 
 
376 aa  295  8e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  43.92 
 
 
392 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
378 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 
372 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  46.3 
 
 
373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  48.22 
 
 
383 aa  289  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 
373 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
375 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  42.4 
 
 
376 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  45.41 
 
 
377 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
373 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  44.36 
 
 
373 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  45.72 
 
 
376 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
367 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  41.37 
 
 
369 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 
369 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 
372 aa  280  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  45.09 
 
 
375 aa  278  8e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 
372 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
374 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  46.03 
 
 
390 aa  276  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 
372 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  42.82 
 
 
376 aa  276  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
393 aa  275  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  42.23 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  44.27 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 
372 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.53 
 
 
368 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  45.3 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
372 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  43.28 
 
 
372 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  48.4 
 
 
380 aa  269  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 
367 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  41.19 
 
 
375 aa  268  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  45.79 
 
 
378 aa  268  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 
374 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  42.52 
 
 
384 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  40.66 
 
 
369 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  40.66 
 
 
369 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  42.03 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  42.03 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  39.3 
 
 
373 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 
374 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.44 
 
 
374 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
382 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 
374 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  38.38 
 
 
371 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.83 
 
 
372 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 
378 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  42.71 
 
 
372 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.83 
 
 
372 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
367 aa  262  6.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  42.48 
 
 
387 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
378 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  42.2 
 
 
372 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  42.78 
 
 
381 aa  260  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  42.13 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
372 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
372 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  36.86 
 
 
388 aa  258  9e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
372 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  42.58 
 
 
379 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
372 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
371 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  39.3 
 
 
373 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  44.92 
 
 
382 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  44.03 
 
 
373 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  40.79 
 
 
374 aa  256  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
390 aa  256  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  45.38 
 
 
370 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 
363 aa  256  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>