More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2872 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  82.09 
 
 
374 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
374 aa  763    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  59.95 
 
 
367 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  60.49 
 
 
367 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  59.95 
 
 
367 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  60.49 
 
 
367 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  59.13 
 
 
386 aa  454  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  59.4 
 
 
367 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2790  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 
367 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.558621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  59.13 
 
 
414 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3028  gamma-glutamyl kinase  58.92 
 
 
353 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0223957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  45.19 
 
 
387 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
373 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 
374 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 
373 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
372 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 
373 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  43.99 
 
 
369 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
378 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
376 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
390 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.41 
 
 
368 aa  279  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  43.16 
 
 
366 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  42.13 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.37 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  42.23 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  44.08 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
372 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
372 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
369 aa  272  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 
369 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 
369 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 
376 aa  272  9e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 
372 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
372 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  43.99 
 
 
371 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 
372 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
378 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  43.32 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
367 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  40 
 
 
373 aa  269  7e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 
378 aa  269  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
372 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  44.01 
 
 
373 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  43.24 
 
 
374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  42.15 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  42.86 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  42.86 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  43.51 
 
 
382 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
367 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  43.89 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  40.88 
 
 
370 aa  265  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
372 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  40.22 
 
 
390 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
372 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
367 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  41.03 
 
 
367 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
372 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  43.36 
 
 
372 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  42.08 
 
 
372 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 
372 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 
372 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  41.8 
 
 
392 aa  262  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 
367 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 
374 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  42.15 
 
 
367 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 
367 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 
384 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 
367 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
395 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 
367 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 
367 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  40.55 
 
 
373 aa  261  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  40.11 
 
 
381 aa  260  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
372 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  43.48 
 
 
380 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  42.42 
 
 
372 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 
363 aa  259  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>