More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3448 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
371 aa  718    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  70.89 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  69.11 
 
 
369 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  68.65 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  62.06 
 
 
388 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  64.15 
 
 
374 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  61.73 
 
 
382 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  64.59 
 
 
374 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  65.04 
 
 
371 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  60 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  63.66 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  58.66 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  56.68 
 
 
393 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  64.23 
 
 
371 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  60.61 
 
 
383 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  65.23 
 
 
382 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  60.65 
 
 
373 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  62.16 
 
 
388 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  58.44 
 
 
393 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  58.4 
 
 
412 aa  362  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  56.52 
 
 
372 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  52.69 
 
 
381 aa  358  8e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  58.24 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  51.89 
 
 
377 aa  352  7e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  56.9 
 
 
419 aa  350  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  61.86 
 
 
376 aa  349  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  54.35 
 
 
401 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  52.56 
 
 
381 aa  346  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  52.04 
 
 
376 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
377 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
377 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
377 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  49.33 
 
 
371 aa  298  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  45.84 
 
 
378 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  46.65 
 
 
373 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  48.92 
 
 
370 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
376 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  47.55 
 
 
367 aa  294  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  47.33 
 
 
383 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  47.06 
 
 
379 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  47.33 
 
 
383 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 
367 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  40.55 
 
 
372 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  45.68 
 
 
369 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  45.68 
 
 
369 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
369 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  46.42 
 
 
382 aa  286  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  46.92 
 
 
375 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  43.24 
 
 
373 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  44.09 
 
 
369 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  46.67 
 
 
377 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
374 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.11 
 
 
383 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  44.41 
 
 
366 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
363 aa  275  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  42.58 
 
 
371 aa  275  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  41.02 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  48.77 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
369 aa  273  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  45.16 
 
 
372 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  45.16 
 
 
372 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  46.52 
 
 
372 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  40.64 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  46.24 
 
 
376 aa  269  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  46.24 
 
 
376 aa  269  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  46.52 
 
 
372 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.16 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 
386 aa  269  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  45.38 
 
 
376 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  42.59 
 
 
384 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.99 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  41.03 
 
 
373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  39.89 
 
 
373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  44.89 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.89 
 
 
375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  42.05 
 
 
376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  41.4 
 
 
367 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  42.86 
 
 
387 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
370 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  41.29 
 
 
367 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  45.16 
 
 
372 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.72 
 
 
376 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 
374 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.12 
 
 
374 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  41.13 
 
 
367 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  41.78 
 
 
373 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  43.25 
 
 
393 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
414 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
380 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  44.26 
 
 
377 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  44.89 
 
 
372 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
379 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  40.43 
 
 
386 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  40.75 
 
 
367 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  40.48 
 
 
386 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  45.16 
 
 
372 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  41.89 
 
 
379 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  40.43 
 
 
367 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
372 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>