More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2056 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
386 aa  766    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  70.81 
 
 
378 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  69.89 
 
 
377 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  70 
 
 
376 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  70.19 
 
 
376 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  66.84 
 
 
387 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  68.39 
 
 
379 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  69.38 
 
 
373 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  68.83 
 
 
379 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  68.29 
 
 
373 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  69.38 
 
 
376 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  67.66 
 
 
371 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  68.56 
 
 
376 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  66.22 
 
 
396 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  65.68 
 
 
377 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  65.68 
 
 
377 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  66.39 
 
 
389 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  66.39 
 
 
389 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  66.12 
 
 
392 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  63.91 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  63.11 
 
 
390 aa  448  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  61.05 
 
 
385 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  62.3 
 
 
378 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  62.3 
 
 
378 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  61.48 
 
 
378 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  57.65 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  58.33 
 
 
383 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  56.28 
 
 
368 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  56.63 
 
 
368 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  54.59 
 
 
382 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  54.97 
 
 
368 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  54.05 
 
 
374 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  53.51 
 
 
370 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  53.39 
 
 
370 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  53.51 
 
 
374 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 
375 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  52.93 
 
 
380 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  52.62 
 
 
377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  54.64 
 
 
377 aa  298  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  47.55 
 
 
373 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
372 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
372 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  46.49 
 
 
372 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  47.12 
 
 
371 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  44.09 
 
 
373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
373 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
372 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  46.58 
 
 
390 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  46.76 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  46.76 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
373 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  46.76 
 
 
372 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
379 aa  280  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
376 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  46.2 
 
 
374 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 
373 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 
372 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
378 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  44.99 
 
 
372 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  44.54 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  44.54 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  53.17 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 
374 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
367 aa  273  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.26 
 
 
378 aa  272  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  46.2 
 
 
372 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  47.78 
 
 
377 aa  272  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  43.92 
 
 
367 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 
367 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  47.11 
 
 
372 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
376 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  46.15 
 
 
375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.99 
 
 
378 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
374 aa  269  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.23 
 
 
374 aa  269  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
367 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  45.05 
 
 
376 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  42.39 
 
 
370 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  45.05 
 
 
376 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>