More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0158 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  90.16 
 
 
376 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
376 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  89.63 
 
 
376 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  87.1 
 
 
379 aa  635    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  87.73 
 
 
376 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  88.44 
 
 
378 aa  651    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  84.68 
 
 
379 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  71.47 
 
 
377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  68.56 
 
 
386 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  69.84 
 
 
387 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  68.21 
 
 
373 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  66.85 
 
 
371 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  67.66 
 
 
373 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  66.84 
 
 
389 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  67.49 
 
 
392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  66.04 
 
 
389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
396 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  64.71 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  65.22 
 
 
377 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  65.22 
 
 
377 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  62.57 
 
 
385 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  64.5 
 
 
378 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  64.23 
 
 
378 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  63.34 
 
 
390 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  64.23 
 
 
378 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  55.26 
 
 
374 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  55.31 
 
 
379 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
370 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
374 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  57.26 
 
 
383 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  54.1 
 
 
368 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  57.37 
 
 
382 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  53.83 
 
 
368 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 
375 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  53.8 
 
 
370 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  55.59 
 
 
368 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  52.89 
 
 
380 aa  332  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.89 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  48.4 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  46.74 
 
 
373 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 
377 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
372 aa  299  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  47.83 
 
 
372 aa  298  9e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  51.52 
 
 
377 aa  295  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.8 
 
 
371 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.24 
 
 
376 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.16 
 
 
372 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  46.77 
 
 
375 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  46.36 
 
 
375 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.31 
 
 
378 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.77 
 
 
374 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 
376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  43.01 
 
 
387 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  47.98 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  42.36 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
373 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
372 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 
372 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
372 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.09 
 
 
373 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  44.68 
 
 
373 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.62 
 
 
390 aa  278  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 
382 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
372 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 
368 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  43.62 
 
 
376 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 
378 aa  277  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.9 
 
 
376 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
372 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  48.2 
 
 
377 aa  275  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  51.52 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  45.45 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
372 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.47 
 
 
374 aa  272  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 
372 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
372 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
372 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
378 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.32 
 
 
383 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  43.58 
 
 
376 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  43.58 
 
 
376 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  40.41 
 
 
381 aa  270  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  45.84 
 
 
374 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  45.31 
 
 
378 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
374 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
372 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  45.11 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  44.57 
 
 
378 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  41.67 
 
 
393 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>