More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0574 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  87.43 
 
 		 378 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  92.8 
 
 		 376 aa  693    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  97.07 
 
 		 376 aa  718    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 376 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  89.63 
 
 		 376 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  86.83 
 
 		 379 aa  631  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  84.14 
 
 		 379 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  70.54 
 
 		 377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  69.38 
 
 		 386 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  69.46 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  67.66 
 
 		 373 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  66.85 
 
 		 371 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  67.39 
 
 		 373 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  66.31 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  65.49 
 
 		 377 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  65.49 
 
 		 377 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  65.95 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  63.64 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  64.96 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  64.86 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  64.58 
 
 		 378 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  63.29 
 
 		 385 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  64.58 
 
 		 378 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  64.58 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  62.8 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  56.4 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  55.98 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  53.55 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  57.37 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  55.8 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  57.65 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  54.62 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  56.91 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  55.1 
 
 		 380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  49.6 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 		 376 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 		 372 aa  299  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.53 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  53.51 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.53 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  45.82 
 
 		 375 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  50.96 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 		 373 aa  288  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  43.82 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.89 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  44.95 
 
 		 373 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.65 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  43.67 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  43.67 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.7 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  52.07 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.24 
 
 		 374 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  43.7 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  44.85 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  46.74 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.36 
 
 		 373 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  45.01 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  42.05 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.29 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  45.01 
 
 		 372 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.9 
 
 		 376 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.82 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.57 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 		 372 aa  272  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 		 378 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  43.65 
 
 		 370 aa  272  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 373 aa  271  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  44.62 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  42.23 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  41.16 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  43.97 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.94 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>