More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3823 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 370 aa  734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  94.05 
 
 		 374 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 374 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  73.7 
 
 		 370 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  73.42 
 
 		 368 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  74.52 
 
 		 368 aa  508  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 		 368 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  59.07 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  58.17 
 
 		 392 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  57.34 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  58.17 
 
 		 389 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  58.73 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  58.17 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  56.06 
 
 		 378 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  57.07 
 
 		 373 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  57.34 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  58.42 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  53.49 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  54.84 
 
 		 376 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  56.15 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  55.16 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  54.3 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  54.92 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  57.53 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  53.53 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  57.53 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  54.99 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  54.99 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  54.99 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  56.99 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  53.51 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  55.07 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  51.37 
 
 		 373 aa  332  7.000000000000001e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  51.93 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 		 377 aa  309  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  51.91 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  46.3 
 
 		 371 aa  288  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  47.43 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  45.92 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  44.3 
 
 		 378 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  46.58 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 		 378 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  41.99 
 
 		 373 aa  276  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 		 374 aa  275  8e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 		 372 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 		 368 aa  275  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 		 379 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  50.41 
 
 		 368 aa  275  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 		 372 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 		 372 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.11 
 
 		 376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 		 374 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  43.37 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  43.37 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  43.37 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  43.37 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  42.12 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  43.37 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  43.37 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  43.37 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  43.37 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  43.37 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  46.54 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.41 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  45.5 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.14 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 367 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 373 aa  268  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>