More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1239 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
375 aa  744    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  60.88 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  57.07 
 
 
385 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  62.12 
 
 
383 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  58.22 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  54.91 
 
 
393 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  54.89 
 
 
389 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  53.8 
 
 
389 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  56.27 
 
 
376 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  56.82 
 
 
370 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  54.87 
 
 
368 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 
376 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 
374 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  55.43 
 
 
379 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  56.82 
 
 
368 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  55.43 
 
 
378 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 
370 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 
374 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 
386 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  55.59 
 
 
390 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  54.6 
 
 
379 aa  363  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  53.76 
 
 
373 aa  362  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  53.2 
 
 
373 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  52.37 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  53.2 
 
 
371 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 
376 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  54.04 
 
 
396 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  56.27 
 
 
378 aa  358  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  56.27 
 
 
378 aa  358  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  53.48 
 
 
377 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  53.48 
 
 
377 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  55.99 
 
 
378 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  53.76 
 
 
377 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 
376 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  53.2 
 
 
387 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  55.15 
 
 
368 aa  345  8e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  52.63 
 
 
380 aa  322  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  50.28 
 
 
373 aa  315  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  48.36 
 
 
373 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
390 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.54 
 
 
376 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  48.9 
 
 
375 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  54.55 
 
 
377 aa  299  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  49.31 
 
 
373 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  47.78 
 
 
372 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 
376 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  44.84 
 
 
387 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  49.72 
 
 
390 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  47.37 
 
 
374 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  46.81 
 
 
372 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  43.41 
 
 
372 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  52.91 
 
 
377 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
375 aa  288  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  47.37 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  45.3 
 
 
373 aa  285  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  48.75 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  46.26 
 
 
378 aa  281  9e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.68 
 
 
371 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  46.81 
 
 
368 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  45.71 
 
 
372 aa  280  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  45.6 
 
 
374 aa  279  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  47.91 
 
 
373 aa  279  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.71 
 
 
372 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  45.86 
 
 
376 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.71 
 
 
378 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  49.31 
 
 
378 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
379 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.71 
 
 
372 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.15 
 
 
378 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.88 
 
 
373 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  46.26 
 
 
376 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  46.39 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  47.09 
 
 
372 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  46.81 
 
 
372 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  46.81 
 
 
372 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  46.81 
 
 
372 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
372 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  37.5 
 
 
373 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
374 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  46.81 
 
 
372 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  44.32 
 
 
376 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  46.26 
 
 
372 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
372 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
372 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  46.54 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  47.37 
 
 
372 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  47.37 
 
 
372 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  46.81 
 
 
373 aa  270  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
372 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
378 aa  268  8e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  47.09 
 
 
372 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  47.37 
 
 
372 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  46.54 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  46.54 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  44.63 
 
 
376 aa  265  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  44.63 
 
 
376 aa  265  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 
380 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  46.54 
 
 
372 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 
372 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>