More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2987 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
396 aa  780    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  97.34 
 
 
377 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  97.34 
 
 
377 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  82.93 
 
 
371 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  81.89 
 
 
373 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  81.62 
 
 
373 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  66.22 
 
 
386 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  67.66 
 
 
378 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  65.14 
 
 
377 aa  481  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  67.03 
 
 
379 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  66.31 
 
 
376 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
379 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  63.45 
 
 
387 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  65.77 
 
 
376 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  66.31 
 
 
376 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  62.57 
 
 
389 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  63.76 
 
 
392 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  62.83 
 
 
389 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  62.83 
 
 
393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
376 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  60.76 
 
 
385 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  61.79 
 
 
390 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  61.26 
 
 
378 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  61.26 
 
 
378 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  62.09 
 
 
378 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  54.84 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  57.92 
 
 
370 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  54.99 
 
 
370 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  54.99 
 
 
374 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  56.45 
 
 
382 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  55.31 
 
 
368 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
374 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  59.41 
 
 
383 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  54.04 
 
 
375 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  54.97 
 
 
368 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  55.59 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
380 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  55.88 
 
 
377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  46.51 
 
 
373 aa  297  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  45.8 
 
 
372 aa  286  4e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
372 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
372 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  44.17 
 
 
372 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
377 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
376 aa  275  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
372 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
373 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
372 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  49.46 
 
 
368 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 
374 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  44.02 
 
 
376 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  44.02 
 
 
376 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
372 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  45.95 
 
 
390 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.93 
 
 
375 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  42.82 
 
 
372 aa  262  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  44.17 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  44.05 
 
 
379 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
372 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 
373 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 
378 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.32 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  43.96 
 
 
372 aa  259  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  42.16 
 
 
378 aa  259  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 
374 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
378 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
378 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  44.6 
 
 
363 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 
376 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
390 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
372 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  44.09 
 
 
372 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 
372 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  255  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  43.56 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  46.56 
 
 
377 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.48 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.01 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  41.91 
 
 
374 aa  253  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>