More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3279 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 387 aa  763    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  78.78 
 
 		 377 aa  592  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  66.84 
 
 		 386 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  69.27 
 
 		 373 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  70 
 
 		 378 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  70.27 
 
 		 379 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  68.46 
 
 		 373 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  69.73 
 
 		 376 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  69.46 
 
 		 376 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  69.09 
 
 		 379 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  67.21 
 
 		 371 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  69.46 
 
 		 376 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  69.84 
 
 		 376 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  64.36 
 
 		 377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  63.45 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  64.36 
 
 		 377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  64.5 
 
 		 389 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  63.54 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  64.5 
 
 		 389 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  61.93 
 
 		 393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 390 aa  434  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  61.79 
 
 		 378 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  61.79 
 
 		 378 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  61.25 
 
 		 378 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  59.67 
 
 		 385 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  54.47 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  54.79 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  54.69 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  54.79 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  55.83 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  54.2 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  56.57 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  54.79 
 
 		 374 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  56.1 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  53.2 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  52.23 
 
 		 380 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  53.23 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 		 376 aa  292  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  46.22 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  45.11 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  50.96 
 
 		 377 aa  283  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  43.48 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.12 
 
 		 374 aa  278  9e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.39 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 372 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 		 372 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 		 372 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.29 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  43.78 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.48 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  43.65 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  45.3 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  45.38 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  43.85 
 
 		 378 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  42.59 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  42.59 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 		 376 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  42.82 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 		 375 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  42.55 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  44.09 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  39.95 
 
 		 373 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.6 
 
 		 374 aa  262  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  41.19 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  42.66 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>