More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4713 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
377 aa  729    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  58.27 
 
 
378 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  58.27 
 
 
378 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  57.18 
 
 
392 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  56.64 
 
 
389 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  56.91 
 
 
389 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  56.65 
 
 
393 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  56.15 
 
 
382 aa  368  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  55.73 
 
 
390 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  57.72 
 
 
378 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  53.51 
 
 
368 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  59.4 
 
 
383 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  56.23 
 
 
370 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  54.81 
 
 
385 aa  358  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  55.95 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  55.91 
 
 
373 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  55.38 
 
 
373 aa  349  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  54.74 
 
 
368 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  52.03 
 
 
379 aa  345  5e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 
370 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 
374 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 
374 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  55.41 
 
 
378 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  55.41 
 
 
376 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  54.55 
 
 
375 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  55.88 
 
 
396 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  54.05 
 
 
376 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  55.11 
 
 
379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  54.64 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  55.35 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  55.35 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  53.64 
 
 
379 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  52.99 
 
 
373 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  53.78 
 
 
368 aa  329  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  53.23 
 
 
387 aa  328  9e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  52.42 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  53.51 
 
 
376 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 
376 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
380 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  48.25 
 
 
390 aa  305  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  49.33 
 
 
373 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  48.79 
 
 
373 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  53.68 
 
 
377 aa  294  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
373 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
372 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 
367 aa  289  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  47.55 
 
 
372 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  47.55 
 
 
372 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  47.09 
 
 
375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
373 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  47.89 
 
 
378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  45.8 
 
 
377 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
373 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  47.31 
 
 
390 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 
372 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
369 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.77 
 
 
376 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  47.09 
 
 
373 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
368 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
371 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  45.8 
 
 
372 aa  275  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  45.79 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  47.41 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  45.26 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 
374 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.74 
 
 
383 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  48.36 
 
 
372 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  48.09 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 
367 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
378 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  44.27 
 
 
374 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 
367 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  51.08 
 
 
377 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 
372 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 
376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 
378 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 
372 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
372 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
372 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  42.05 
 
 
367 aa  265  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  42.28 
 
 
367 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  42.28 
 
 
367 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.77 
 
 
376 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  45.01 
 
 
374 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
372 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  42.05 
 
 
374 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
369 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
369 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  41.53 
 
 
372 aa  263  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>