More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1467 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 368 aa  724    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  72.83 
 
 		 368 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  74.52 
 
 		 370 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  74.52 
 
 		 374 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  73.76 
 
 		 374 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  71.51 
 
 		 370 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  70.65 
 
 		 368 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  58.29 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  57.65 
 
 		 393 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  57.72 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  58.01 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  58.47 
 
 		 373 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  57.34 
 
 		 385 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  57.92 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  56.56 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  56.91 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  56.63 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  55.52 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  55.52 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  55.83 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  53.83 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  59.07 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  56.82 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  54.1 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  54.1 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  57.99 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  56.22 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  57.45 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  55.8 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  57.45 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  55.59 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  52.3 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  54.97 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  54.97 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  54.64 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  53.83 
 
 		 376 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  51.64 
 
 		 373 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  54.74 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  52.49 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  54.2 
 
 		 377 aa  305  9.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 		 376 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  44.57 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.41 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  47.01 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  46.93 
 
 		 373 aa  295  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  46.65 
 
 		 373 aa  295  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.76 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 		 372 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 376 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  46.2 
 
 		 379 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  45.53 
 
 		 376 aa  281  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  47.03 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.12 
 
 		 374 aa  279  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 		 372 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  45.82 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  46.76 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  43.44 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.57 
 
 		 368 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  43.44 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 		 378 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 		 372 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  51.87 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  45.68 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.23 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  45.68 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  44.09 
 
 		 378 aa  272  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  45.71 
 
 		 370 aa  271  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  45.7 
 
 		 372 aa  271  9e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  43.9 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  45.7 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  42.27 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  45.8 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>