More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3896 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 380 aa  736    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  71.43 
 
 		 368 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  61.21 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  55.65 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  53.99 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  55.92 
 
 		 377 aa  346  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  54.27 
 
 		 376 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  54.42 
 
 		 376 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  51.93 
 
 		 379 aa  345  6e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  53.68 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  52.93 
 
 		 386 aa  343  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  55.1 
 
 		 376 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  52.62 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  55.83 
 
 		 383 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  51.79 
 
 		 389 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  52.34 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  52.23 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  51.79 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  51.93 
 
 		 370 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  51.93 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  51.66 
 
 		 392 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  52.63 
 
 		 375 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  52.62 
 
 		 390 aa  322  9.000000000000001e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  52.21 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  52.21 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  50.26 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  52.21 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  49.74 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  52.21 
 
 		 370 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  50.83 
 
 		 374 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  52.89 
 
 		 376 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  49.21 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  49.21 
 
 		 377 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  49.21 
 
 		 377 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  52.49 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 		 368 aa  303  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  52.62 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.67 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  46.09 
 
 		 373 aa  266  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.66 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  45.84 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  45.84 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 		 379 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  46.3 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.31 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  46.03 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 		 370 aa  258  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  43.99 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  44.77 
 
 		 372 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.05 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 		 372 aa  253  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.64 
 
 		 390 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  41.44 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  44.19 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 		 372 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  37.33 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 376 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  40.55 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  41.14 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  37.26 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  39.84 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.22 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  41.32 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  41.85 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 373 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 		 369 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  40.33 
 
 		 374 aa  242  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  44.69 
 
 		 377 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  44.2 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  44.2 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  39.56 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  41.11 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  42.03 
 
 		 377 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  44.2 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  42.82 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  41.78 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  42.09 
 
 		 376 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  42.26 
 
 		 372 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>