More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0252 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  87.7 
 
 
378 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
376 aa  740    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  90.16 
 
 
376 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  97.07 
 
 
376 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  92 
 
 
376 aa  685    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  87.1 
 
 
379 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  85.22 
 
 
379 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  71.08 
 
 
377 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  70.19 
 
 
386 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  69.73 
 
 
387 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  67.93 
 
 
373 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  67.93 
 
 
373 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  67.12 
 
 
371 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  66.31 
 
 
396 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  65.49 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  65.49 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  66.22 
 
 
389 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  65.5 
 
 
392 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  65.14 
 
 
389 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  63.9 
 
 
393 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  64.58 
 
 
378 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  64.58 
 
 
378 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  63.34 
 
 
390 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  63.01 
 
 
385 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  64.05 
 
 
378 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  56.68 
 
 
379 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  55.43 
 
 
374 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  57.64 
 
 
382 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  55.16 
 
 
370 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  55.16 
 
 
374 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  57.65 
 
 
383 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  53.28 
 
 
368 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  55.52 
 
 
368 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 
375 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  54.62 
 
 
370 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  57.18 
 
 
368 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  54.27 
 
 
380 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  49.87 
 
 
373 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  47.83 
 
 
372 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
373 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  54.05 
 
 
377 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.16 
 
 
372 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 
373 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  44.56 
 
 
376 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.99 
 
 
371 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.27 
 
 
376 aa  292  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
372 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
377 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 
378 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
372 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
375 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.7 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.62 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  45.28 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.24 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  44.5 
 
 
373 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 
368 aa  282  9e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 
372 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  42.22 
 
 
387 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  46.74 
 
 
372 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  44.85 
 
 
382 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
376 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.82 
 
 
390 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
372 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.38 
 
 
374 aa  280  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
372 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 
373 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 
372 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  43.7 
 
 
378 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
372 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
373 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
372 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
372 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  44.92 
 
 
372 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
372 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 
373 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  44.48 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
378 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
368 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
372 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  44.65 
 
 
372 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
378 aa  272  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  45.11 
 
 
379 aa  272  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.36 
 
 
376 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
372 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 
372 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  47.65 
 
 
377 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 
372 aa  270  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.67 
 
 
374 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  42.15 
 
 
376 aa  269  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>