More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0481 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
406 aa  822    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  61.26 
 
 
375 aa  496  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.76 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  45.24 
 
 
373 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  45.03 
 
 
373 aa  308  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.97 
 
 
390 aa  308  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  43.85 
 
 
372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 
373 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
373 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
373 aa  292  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  42.67 
 
 
378 aa  287  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  42.16 
 
 
373 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  44.33 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  42.26 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  43.8 
 
 
373 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  40.32 
 
 
383 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  44.04 
 
 
381 aa  280  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  41.69 
 
 
374 aa  278  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 
370 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 
376 aa  275  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  40.37 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  41.58 
 
 
375 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  41.11 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  40.58 
 
 
374 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  40.76 
 
 
377 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  38.64 
 
 
392 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  42.12 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
369 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 
372 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  40.74 
 
 
373 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  39.21 
 
 
393 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  39.2 
 
 
376 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  38.61 
 
 
393 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  39.67 
 
 
363 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  39.2 
 
 
382 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  41.6 
 
 
372 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  40.91 
 
 
372 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  41.47 
 
 
379 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  40.68 
 
 
373 aa  263  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  38.92 
 
 
372 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  40.48 
 
 
376 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  41.14 
 
 
373 aa  261  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
372 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  42.12 
 
 
374 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
372 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
372 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
372 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  38.92 
 
 
372 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  40.75 
 
 
376 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  39.63 
 
 
387 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  41.6 
 
 
371 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  40.21 
 
 
367 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  39.57 
 
 
379 aa  260  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  38.85 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  40 
 
 
374 aa  259  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  42.98 
 
 
382 aa  259  8e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  41.29 
 
 
374 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  40.32 
 
 
369 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  40.32 
 
 
369 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  37.17 
 
 
383 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  37.17 
 
 
383 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  40.92 
 
 
370 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 
372 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  36.65 
 
 
379 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  38.3 
 
 
371 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  38.3 
 
 
373 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  43.2 
 
 
369 aa  256  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  40.32 
 
 
372 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  39.74 
 
 
393 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  39.04 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  38.16 
 
 
390 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  39.41 
 
 
372 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  42.67 
 
 
372 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
392 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  39.95 
 
 
378 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  40.91 
 
 
370 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  39.35 
 
 
414 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  37.77 
 
 
373 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
394 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  39.41 
 
 
367 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  39.79 
 
 
374 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  39.95 
 
 
376 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
372 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 
377 aa  249  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  39.27 
 
 
382 aa  249  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  40.85 
 
 
374 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>