More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1864 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  86.54 
 
 
379 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
377 aa  756    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  85.75 
 
 
379 aa  631  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  74.45 
 
 
369 aa  558  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  67.03 
 
 
367 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  65.19 
 
 
374 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  65.03 
 
 
372 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  65.03 
 
 
372 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  65.03 
 
 
372 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  65.03 
 
 
372 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  64.86 
 
 
379 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  66.57 
 
 
367 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  64.31 
 
 
370 aa  481  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  481  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  66.57 
 
 
367 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 
367 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  66.12 
 
 
367 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  63.81 
 
 
372 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  64.09 
 
 
372 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  66.21 
 
 
367 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  66.21 
 
 
367 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  66.21 
 
 
367 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  63.81 
 
 
372 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  62.43 
 
 
369 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  64.48 
 
 
372 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  64.21 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  65.4 
 
 
367 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  64.21 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  64.21 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  65.22 
 
 
367 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  64.21 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  65.12 
 
 
367 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  64.85 
 
 
367 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  58.74 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  56.84 
 
 
378 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  50.56 
 
 
370 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  51.23 
 
 
367 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  51.78 
 
 
393 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  51.11 
 
 
363 aa  353  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  48.49 
 
 
373 aa  348  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  48.22 
 
 
373 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  54.97 
 
 
370 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  48.49 
 
 
373 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
373 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.72 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  48.23 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 
374 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 
372 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.08 
 
 
373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
372 aa  308  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  45.05 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.41 
 
 
376 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.41 
 
 
378 aa  305  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  46.9 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.17 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  49.44 
 
 
373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  49.44 
 
 
373 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
371 aa  299  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  43.44 
 
 
373 aa  299  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  45.15 
 
 
366 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
367 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 
372 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.71 
 
 
372 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  46.9 
 
 
372 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  46.9 
 
 
372 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
372 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  46.9 
 
 
372 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.71 
 
 
372 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  43.61 
 
 
376 aa  295  8e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 
378 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
394 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  43.09 
 
 
376 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  43.09 
 
 
376 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  45.5 
 
 
372 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>