21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0587 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  416  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  65.13 
 
 
206 aa  277  9e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.57 
 
 
240 aa  254  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  60.7 
 
 
219 aa  246  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  59.59 
 
 
217 aa  239  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  47.06 
 
 
228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  47.34 
 
 
227 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  32.59 
 
 
541 aa  68.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  34.85 
 
 
626 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  30.91 
 
 
544 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  33.08 
 
 
615 aa  59.3  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  32.62 
 
 
541 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  32.06 
 
 
546 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  30.43 
 
 
566 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  28.47 
 
 
546 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  32.22 
 
 
590 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  37.31 
 
 
585 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1279  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.04 
 
 
252 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  39.68 
 
 
582 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  36.11 
 
 
600 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  40.68 
 
 
608 aa  44.7  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>