21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3462 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  470  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  71.81 
 
 		 228 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.67 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  44.09 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  47.34 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  43.75 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  41.99 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  27.83 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  30.43 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  27.14 
 
 		 585 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  29.02 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  27.33 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  26.02 
 
 		 608 aa  58.9  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  33.04 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  27.7 
 
 		 582 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  38.03 
 
 		 566 aa  52.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  30.51 
 
 		 590 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  32.32 
 
 		 600 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1279  queuine tRNA-ribosyltransferase  21.86 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  23.65 
 
 		 546 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  26.61 
 
 		 544 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>