28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0923 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  100 
 
 
497 aa  1018    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  30.98 
 
 
541 aa  219  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  30.58 
 
 
626 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  31.7 
 
 
546 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  31.38 
 
 
544 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  30.96 
 
 
546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  30.44 
 
 
615 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  32.27 
 
 
566 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  29.05 
 
 
582 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  29.11 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.78 
 
 
585 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  30.21 
 
 
539 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  28.36 
 
 
541 aa  163  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  30.17 
 
 
538 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  30.52 
 
 
538 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  29.39 
 
 
602 aa  159  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  29.74 
 
 
538 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  25.49 
 
 
600 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  31.58 
 
 
590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.18 
 
 
649 aa  50.8  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.16 
 
 
649 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  26.9 
 
 
217 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  19.38 
 
 
543 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  29.79 
 
 
219 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  40.35 
 
 
206 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.84 
 
 
240 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.06 
 
 
652 aa  43.9  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.1 
 
 
649 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>