21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2194 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  447  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  67.53 
 
 
219 aa  270  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  59.9 
 
 
206 aa  246  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  59.59 
 
 
201 aa  239  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.06 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  39.91 
 
 
228 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  43.75 
 
 
227 aa  161  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  31.06 
 
 
541 aa  68.6  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  31.85 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  32.79 
 
 
541 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  29.55 
 
 
544 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  30.83 
 
 
566 aa  55.8  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  28.03 
 
 
546 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  29.63 
 
 
615 aa  52  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  28.23 
 
 
546 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.9 
 
 
585 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  37.21 
 
 
608 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.78 
 
 
582 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  33.71 
 
 
590 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  38.27 
 
 
600 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  26.9 
 
 
497 aa  45.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>