More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0438 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
379 aa  791    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0600679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
375 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 
369 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.48 
 
 
373 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
379 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 
380 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
371 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
372 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
395 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
370 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
373 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
370 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
377 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.87 
 
 
380 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
371 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1506  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.19 
 
 
385 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.966603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
374 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1789  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
393 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320337  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.42 
 
 
379 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 
372 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.19 
 
 
407 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.24 
 
 
388 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.68 
 
 
374 aa  364  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
372 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0839  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 
375 aa  363  2e-99  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.175352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
369 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
369 aa  362  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 
386 aa  362  4e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
357 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 
372 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 
367 aa  361  9e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 
373 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.5 
 
 
380 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 
370 aa  358  9e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.37 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.93 
 
 
387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.3 
 
 
383 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.14 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.91 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.91 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.14 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
379 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.55 
 
 
392 aa  355  1e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
370 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.19 
 
 
380 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.05 
 
 
380 aa  353  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
404 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.8 
 
 
396 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.23 
 
 
373 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.55 
 
 
392 aa  353  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.31 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.2 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.99 
 
 
384 aa  352  8.999999999999999e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.67 
 
 
382 aa  351  1e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.52 
 
 
383 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
395 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.34 
 
 
367 aa  350  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
447 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
395 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.97 
 
 
370 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.15 
 
 
379 aa  349  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.45 
 
 
371 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.34 
 
 
394 aa  349  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.49 
 
 
379 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.49 
 
 
379 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.21 
 
 
394 aa  348  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
373 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
384 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.78 
 
 
380 aa  347  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 
375 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.49 
 
 
379 aa  347  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.99 
 
 
376 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
472 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.36 
 
 
391 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.68 
 
 
373 aa  346  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
355 aa  346  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
397 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.5 
 
 
372 aa  346  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.6 
 
 
374 aa  345  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.88 
 
 
392 aa  346  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  48 
 
 
400 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
397 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
397 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.15 
 
 
395 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
397 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
397 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  46.99 
 
 
371 aa  345  8e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
397 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.4 
 
 
376 aa  344  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
374 aa  344  1e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.15 
 
 
367 aa  344  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>