More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_07170  tRNA-guanine transglycosylase  100 
 
 
382 aa  802    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.934048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12610  tRNA-guanine transglycosylase  77.23 
 
 
382 aa  626  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0983  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.77 
 
 
381 aa  564  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.410572 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0518  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.84 
 
 
405 aa  463  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 
370 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
375 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 
373 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.61 
 
 
373 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
373 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.1 
 
 
365 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 
369 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
374 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.52 
 
 
367 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
392 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 
369 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.03 
 
 
357 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 
394 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.62 
 
 
372 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.9 
 
 
372 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.62 
 
 
387 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 
379 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
370 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 
379 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
336 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.44 
 
 
379 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.35 
 
 
370 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
379 aa  359  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 
384 aa  358  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.18 
 
 
371 aa  358  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.89 
 
 
384 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.34 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.12 
 
 
375 aa  356  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.73 
 
 
355 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
380 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.55 
 
 
372 aa  352  7e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.68 
 
 
379 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.41 
 
 
380 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.68 
 
 
379 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.33 
 
 
384 aa  350  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.28 
 
 
374 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.11 
 
 
373 aa  349  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.59 
 
 
379 aa  348  9e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.59 
 
 
379 aa  348  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.59 
 
 
379 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.59 
 
 
379 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.59 
 
 
379 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.59 
 
 
379 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.59 
 
 
379 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.59 
 
 
379 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.59 
 
 
379 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.82 
 
 
384 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 
367 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.52 
 
 
375 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03501  tRNA-guanine transglycosylase  46.19 
 
 
376 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
372 aa  345  7e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.24 
 
 
388 aa  345  7e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.15 
 
 
372 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.54 
 
 
371 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.48 
 
 
381 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.36 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.43 
 
 
376 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.67 
 
 
380 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.09 
 
 
383 aa  342  7e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.21 
 
 
371 aa  342  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.21 
 
 
381 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.85 
 
 
380 aa  342  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.49 
 
 
383 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.67 
 
 
376 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.36 
 
 
367 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.82 
 
 
379 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.92 
 
 
372 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.49 
 
 
379 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.37 
 
 
382 aa  339  4e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.65 
 
 
385 aa  339  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
368 aa  339  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.16 
 
 
368 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.1 
 
 
388 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.19 
 
 
395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 
379 aa  338  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.48 
 
 
368 aa  338  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4271  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.9 
 
 
384 aa  338  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0374277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.41 
 
 
376 aa  338  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.68 
 
 
369 aa  338  9e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.95 
 
 
369 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.28 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.87 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.39 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.28 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.05 
 
 
380 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.11 
 
 
362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.72 
 
 
368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.67 
 
 
379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.41 
 
 
377 aa  335  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.58 
 
 
392 aa  334  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.85 
 
 
407 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.4 
 
 
380 aa  334  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>