More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0019 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 379 aa  772    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  86.28 
 
 		 379 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.06 
 
 		 383 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.91 
 
 		 383 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5516  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.8 
 
 		 378 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.575246  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2655  queuine tRNA-ribosyltransferase  80 
 
 		 378 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.14 
 
 		 376 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1938  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.33 
 
 		 376 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1752  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.73 
 
 		 376 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0577466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2451  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.07 
 
 		 376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0606971  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1091  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.58 
 
 		 377 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1052  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.58 
 
 		 377 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4271  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.59 
 
 		 384 aa  564  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2176  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.73 
 
 		 383 aa  566  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.66 
 
 		 376 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2335  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.01 
 
 		 386 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.0584055 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0741  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.11 
 
 		 377 aa  534  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.48 
 
 		 378 aa  524  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.67 
 
 		 379 aa  504  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.3 
 
 		 388 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.12 
 
 		 377 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4363  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.2 
 
 		 382 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2603  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 		 380 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1771  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.41 
 
 		 377 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2869  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.13 
 
 		 380 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.95 
 
 		 376 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1795  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.95 
 
 		 377 aa  490  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000838007  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.67 
 
 		 376 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.21 
 
 		 376 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.66 
 
 		 380 aa  481  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2592  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.03 
 
 		 377 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00946662  normal  0.321303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.37 
 
 		 376 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.59 
 
 		 376 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.11 
 
 		 374 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.03 
 
 		 375 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.92 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.91 
 
 		 380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0133  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.1 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1142  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.14 
 
 		 387 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  60 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1340  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.78 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.20108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.11 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.72 
 
 		 372 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 		 372 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.3 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.39 
 
 		 370 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.04 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.4 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.42 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.82 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.37 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  54.47 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.93 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.56 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.74 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.1 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.16 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.72 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.44 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.19 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.16 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.88 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.9 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.72 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.12 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.72 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.76 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.4 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.29 
 
 		 370 aa  381  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 		 374 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.51 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.13 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.6 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.5 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.02 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 		 374 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.6 
 
 		 375 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 		 374 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.61 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.6 
 
 		 375 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.6 
 
 		 375 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.6 
 
 		 375 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.64 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 		 367 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>