More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1866 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
380 aa  788    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.58 
 
 
371 aa  564  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.81 
 
 
379 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.03 
 
 
378 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2176  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.59 
 
 
383 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1091  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.74 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1052  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.27 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.99 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.31 
 
 
383 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.64 
 
 
379 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.99 
 
 
380 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.13 
 
 
376 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.43 
 
 
383 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.19 
 
 
376 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.19 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.19 
 
 
376 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4271  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.27 
 
 
384 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0374277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.93 
 
 
376 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1938  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.41 
 
 
376 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.78 
 
 
376 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2451  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.52 
 
 
376 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0606971  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1752  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.89 
 
 
376 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0577466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.6 
 
 
374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.19 
 
 
375 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5516  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.56 
 
 
378 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.575246  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.22 
 
 
377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2655  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.87 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0741  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.76 
 
 
377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2335  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.53 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.0584055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.05 
 
 
376 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.63 
 
 
379 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0133  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.36 
 
 
414 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954831  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2869  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.13 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2603  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.58 
 
 
380 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.52 
 
 
375 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1771  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.68 
 
 
377 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1795  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.13 
 
 
377 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000838007  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1340  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.22 
 
 
376 aa  428  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.20108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.64 
 
 
370 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4363  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.22 
 
 
382 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2592  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.6 
 
 
377 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00946662  normal  0.321303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.46 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.4 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  55.89 
 
 
371 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.68 
 
 
386 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
371 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.57 
 
 
372 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.14 
 
 
381 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.08 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1142  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.77 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.64 
 
 
370 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.37 
 
 
371 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.22 
 
 
377 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.37 
 
 
374 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.56 
 
 
370 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
374 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
374 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.85 
 
 
380 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
374 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
374 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.87 
 
 
371 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 
377 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.14 
 
 
377 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 
381 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
375 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.2 
 
 
385 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 
374 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.61 
 
 
375 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.17 
 
 
387 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.14 
 
 
377 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
375 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
374 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
375 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 
374 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
377 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 
374 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 
370 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
375 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 
374 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.59 
 
 
376 aa  388  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 
374 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
375 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 
374 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
375 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
375 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.04 
 
 
371 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
375 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.04 
 
 
377 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.59 
 
 
377 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
374 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  53.06 
 
 
375 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
377 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
375 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
375 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.92 
 
 
373 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
375 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>