More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1052 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2176  queuine tRNA-ribosyltransferase  94.68 
 
 		 383 aa  741    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1091  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.47 
 
 		 377 aa  776    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.82 
 
 		 376 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150936  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1052  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 377 aa  780    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.25 
 
 		 376 aa  628  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2451  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.55 
 
 		 376 aa  614  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0606971  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1752  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.17 
 
 		 376 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0577466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1938  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.71 
 
 		 376 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0741  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.93 
 
 		 377 aa  592  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.73 
 
 		 379 aa  584  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.46 
 
 		 383 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.07 
 
 		 383 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.45 
 
 		 379 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5516  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.16 
 
 		 378 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.575246  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4271  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.32 
 
 		 384 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2655  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.89 
 
 		 378 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2603  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.47 
 
 		 380 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2592  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.87 
 
 		 377 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00946662  normal  0.321303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.4 
 
 		 377 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.17 
 
 		 378 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2335  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.21 
 
 		 386 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.0584055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2869  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.13 
 
 		 380 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4363  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.3 
 
 		 382 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1795  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.78 
 
 		 377 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000838007  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1771  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.72 
 
 		 377 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.38 
 
 		 379 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.03 
 
 		 388 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.26 
 
 		 376 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.7 
 
 		 376 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.96 
 
 		 376 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.27 
 
 		 380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.96 
 
 		 380 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.7 
 
 		 376 aa  460  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.08 
 
 		 376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.73 
 
 		 375 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1340  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.76 
 
 		 376 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.20108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.1 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1142  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.12 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.49 
 
 		 374 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0133  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.62 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.14 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.46 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.74 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.3 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.46 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  55.46 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.81 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.34 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.74 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.03 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.2 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.59 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.34 
 
 		 382 aa  388  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.09 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.85 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.34 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.56 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.57 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.03 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.55 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.03 
 
 		 370 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.52 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.52 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.53 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.29 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.54 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.22 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.65 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.07 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.68 
 
 		 377 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.68 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.15 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.77 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.68 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.15 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.21 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.79 
 
 		 381 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.9 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.5 
 
 		 391 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.66 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.15 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.15 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.08 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.08 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.21 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.63 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.08 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>