More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2655 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2655  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 378 aa  773    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5516  queuine tRNA-ribosyltransferase  93.39 
 
 		 378 aa  728    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.575246  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.95 
 
 		 379 aa  614  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.16 
 
 		 383 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.77 
 
 		 383 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  80 
 
 		 379 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1752  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.99 
 
 		 376 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0577466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1938  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.85 
 
 		 376 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2451  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.81 
 
 		 376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0606971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2176  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.78 
 
 		 383 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.97 
 
 		 376 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1091  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.24 
 
 		 377 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1052  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.89 
 
 		 377 aa  554  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.7 
 
 		 376 aa  552  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4271  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.35 
 
 		 384 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2335  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.38 
 
 		 386 aa  539  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.0584055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.29 
 
 		 378 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0741  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.49 
 
 		 377 aa  518  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.77 
 
 		 379 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.83 
 
 		 380 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.93 
 
 		 388 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4363  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.4 
 
 		 382 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.71 
 
 		 376 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1795  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.08 
 
 		 377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000838007  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.47 
 
 		 377 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.43 
 
 		 376 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2592  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.2 
 
 		 377 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00946662  normal  0.321303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1771  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.67 
 
 		 377 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.95 
 
 		 376 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2869  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.83 
 
 		 380 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2603  queuine tRNA-ribosyltransferase  63 
 
 		 380 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.23 
 
 		 376 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.32 
 
 		 376 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.03 
 
 		 375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.5 
 
 		 371 aa  444  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.87 
 
 		 380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1142  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.16 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.6 
 
 		 374 aa  438  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0133  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.87 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1340  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.42 
 
 		 376 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.20108  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.69 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.34 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  55.31 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.99 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.15 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.15 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.77 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.52 
 
 		 377 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.1 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.72 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  54.87 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.15 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.15 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 		 374 aa  391  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 		 375 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.62 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.77 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.35 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 		 371 aa  388  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 		 371 aa  388  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.85 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.85 
 
 		 385 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.24 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.36 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.59 
 
 		 395 aa  388  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.4 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.78 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.24 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.49 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 		 375 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.92 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.76 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.37 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.83 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.81 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.74 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.5 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.61 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.1 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>