More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0518 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0518  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 405 aa  852    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174358 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07170  tRNA-guanine transglycosylase  59.84 
 
 		 382 aa  463  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.934048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12610  tRNA-guanine transglycosylase  58.79 
 
 		 382 aa  461  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0983  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.65 
 
 		 381 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.410572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.15 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.47 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.88 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.11 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 375 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.04 
 
 		 371 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.5 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.45 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.21 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 		 369 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.79 
 
 		 369 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.17 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.12 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.64 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.49 
 
 		 384 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.65 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 		 367 aa  363  4e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 		 394 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 		 376 aa  362  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.18 
 
 		 380 aa  359  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 		 383 aa  358  8e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 		 372 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.87 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 336 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 382 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 		 373 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 		 384 aa  352  5e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 373 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.91 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.19 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.51 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.8 
 
 		 399 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 		 380 aa  350  3e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 383 aa  350  3e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 376 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.58 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4271  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.08 
 
 		 384 aa  349  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 371 aa  346  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.01 
 
 		 370 aa  346  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.62 
 
 		 375 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1052  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 377 aa  346  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1091  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 377 aa  345  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2451  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.04 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0606971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 385 aa  345  7e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 407 aa  345  7e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.94 
 
 		 392 aa  345  8e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.21 
 
 		 377 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 		 379 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.27 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1938  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.21 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.94 
 
 		 392 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0741  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 		 377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.04 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.48 
 
 		 376 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4479  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.51 
 
 		 390 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.76 
 
 		 376 aa  342  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 		 371 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.81 
 
 		 379 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.89 
 
 		 388 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 		 368 aa  342  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 		 371 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 		 392 aa  342  8e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 376 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.88 
 
 		 369 aa  342  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>