More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12610 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12610  tRNA-guanine transglycosylase  100 
 
 
382 aa  799    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07170  tRNA-guanine transglycosylase  77.23 
 
 
382 aa  626  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.934048 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0983  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.99 
 
 
381 aa  553  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.410572 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0518  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.79 
 
 
405 aa  461  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.8 
 
 
373 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 
373 aa  378  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
374 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.91 
 
 
365 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
372 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
392 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 
370 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.94 
 
 
372 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.24 
 
 
375 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 
373 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
367 aa  360  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.81 
 
 
369 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  358  8e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  358  8e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.19 
 
 
384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.81 
 
 
387 aa  355  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.81 
 
 
371 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 
379 aa  355  6.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  355  1e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.3 
 
 
369 aa  354  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 
375 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.51 
 
 
357 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.01 
 
 
380 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 
374 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.23 
 
 
380 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.22 
 
 
370 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.45 
 
 
370 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
336 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.95 
 
 
373 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
355 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.41 
 
 
383 aa  344  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.85 
 
 
372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.35 
 
 
379 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  342  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  342  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  342  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
379 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.87 
 
 
384 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.36 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
384 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  48 
 
 
382 aa  338  7e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.51 
 
 
372 aa  338  9e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.81 
 
 
375 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2655  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.47 
 
 
378 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.36 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.77 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.79 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.59 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.28 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.43 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.62 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.45 
 
 
384 aa  335  5.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.99 
 
 
380 aa  335  7e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.15 
 
 
388 aa  335  7e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.83 
 
 
376 aa  335  7.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.99 
 
 
383 aa  333  2e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.11 
 
 
366 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.65 
 
 
381 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.8 
 
 
376 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.99 
 
 
383 aa  333  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 
379 aa  333  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.71 
 
 
375 aa  332  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.59 
 
 
376 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.09 
 
 
380 aa  332  8e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 
383 aa  332  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 
378 aa  332  8e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.43 
 
 
371 aa  332  8e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.59 
 
 
376 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.07 
 
 
372 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5516  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.87 
 
 
378 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.575246  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.08 
 
 
373 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03501  tRNA-guanine transglycosylase  44.47 
 
 
376 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.38 
 
 
372 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.83 
 
 
367 aa  329  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.91 
 
 
380 aa  329  4e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.14 
 
 
383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.88 
 
 
377 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.97 
 
 
385 aa  329  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.9 
 
 
367 aa  328  9e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4479  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.97 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0710937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.53 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.16 
 
 
368 aa  326  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.72 
 
 
377 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.47 
 
 
383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.3 
 
 
379 aa  326  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.95 
 
 
376 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0549  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.47 
 
 
390 aa  325  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.62 
 
 
407 aa  325  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>