More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2476 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  83.03 
 
 		 384 aa  676    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 383 aa  786    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.54 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.72 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.1 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.99 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.05 
 
 		 380 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 		 380 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.57 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 		 372 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.19 
 
 		 379 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.73 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.59 
 
 		 394 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.99 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.02 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 		 373 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.17 
 
 		 387 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.62 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.58 
 
 		 370 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.93 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.19 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.5 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.45 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.28 
 
 		 395 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.71 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.07 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.74 
 
 		 367 aa  388  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.24 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.67 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 388 aa  381  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.34 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0267  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 		 374 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.68 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  51.07 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.55 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4271  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.01 
 
 		 384 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.49 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.68 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.15 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.09 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.28 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.89 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 		 375 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.37 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.85 
 
 		 381 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.74 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 		 375 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.85 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  49.33 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2176  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.34 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1091  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.25 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.97 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.36 
 
 		 370 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>