More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0238 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0267  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.63 
 
 		 372 aa  672    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 372 aa  769    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24901  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.76 
 
 		 372 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.77 
 
 		 372 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.16 
 
 		 376 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03501  tRNA-guanine transglycosylase  69.62 
 
 		 376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02931  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.9 
 
 		 372 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02941  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.9 
 
 		 372 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.483841  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0273  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.1 
 
 		 372 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03041  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.29 
 
 		 372 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.02 
 
 		 384 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.81 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.91 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.36 
 
 		 381 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.71 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.5 
 
 		 367 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.6 
 
 		 366 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.33 
 
 		 366 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 		 380 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.1 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.67 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.87 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.71 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.83 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.01 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.87 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.7 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.87 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.15 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.99 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.87 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 372 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 379 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.42 
 
 		 379 aa  362  6e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.14 
 
 		 382 aa  358  6e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.14 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.83 
 
 		 375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 		 392 aa  355  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 357 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.17 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.18 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.95 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.18 
 
 		 371 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.95 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.06 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.43 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 		 369 aa  349  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.44 
 
 		 367 aa  348  9e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.66 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07170  tRNA-guanine transglycosylase  48.53 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.934048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.44 
 
 		 380 aa  342  5e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.6 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.1 
 
 		 370 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.02 
 
 		 380 aa  338  9e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.02 
 
 		 380 aa  338  9e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0983  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.44 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.410572 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.33 
 
 		 368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.33 
 
 		 368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0518  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.91 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174358 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1052  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.9 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4271  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.61 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374277 
 
 
-
 
NC_004310  BR1091  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.9 
 
 		 377 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 		 395 aa  336  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.96 
 
 		 378 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 		 387 aa  335  5.999999999999999e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.68 
 
 		 382 aa  335  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2176  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.49 
 
 		 383 aa  335  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.15 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.48 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.18 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.53 
 
 		 405 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.56 
 
 		 385 aa  332  8e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.28 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12610  tRNA-guanine transglycosylase  47.07 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>