More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1637 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
376 aa  788    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03501  tRNA-guanine transglycosylase  98.67 
 
 
376 aa  780    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24901  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.92 
 
 
372 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.16 
 
 
372 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.24 
 
 
372 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0267  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.7 
 
 
372 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02931  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.71 
 
 
372 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02941  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.25 
 
 
372 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.483841  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0273  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.44 
 
 
372 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03041  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.83 
 
 
372 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.93 
 
 
384 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.5 
 
 
387 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.6 
 
 
381 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.22 
 
 
375 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.66 
 
 
367 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.65 
 
 
394 aa  468  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.07 
 
 
366 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.07 
 
 
366 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
373 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.15 
 
 
373 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
380 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 
370 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
380 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.44 
 
 
379 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
370 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.89 
 
 
379 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
379 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
379 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
379 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
379 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
379 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
384 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
379 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.56 
 
 
394 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
379 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
383 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.06 
 
 
379 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.06 
 
 
379 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.44 
 
 
372 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
372 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
373 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.29 
 
 
374 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.14 
 
 
392 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.45 
 
 
369 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
372 aa  363  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.35 
 
 
379 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.35 
 
 
379 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.59 
 
 
365 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.74 
 
 
372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
395 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.29 
 
 
375 aa  358  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.59 
 
 
379 aa  358  7e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
388 aa  358  7e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.32 
 
 
371 aa  358  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.14 
 
 
375 aa  358  8e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.34 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.74 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.85 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.72 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.01 
 
 
382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.29 
 
 
367 aa  355  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.3 
 
 
369 aa  356  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.84 
 
 
373 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.27 
 
 
370 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.7 
 
 
369 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.25 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.84 
 
 
376 aa  352  4e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.11 
 
 
383 aa  353  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.33 
 
 
368 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
374 aa  352  7e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.56 
 
 
378 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  47.54 
 
 
382 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  50.44 
 
 
371 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 
374 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 
374 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.76 
 
 
368 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 
374 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 
374 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.02 
 
 
367 aa  350  3e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.74 
 
 
377 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 
382 aa  349  4e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.73 
 
 
381 aa  349  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.33 
 
 
368 aa  348  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.97 
 
 
387 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
381 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.28 
 
 
387 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.22 
 
 
376 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.41 
 
 
371 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.97 
 
 
374 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.97 
 
 
374 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.97 
 
 
374 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.69 
 
 
374 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
377 aa  346  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.32 
 
 
373 aa  346  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.55 
 
 
374 aa  346  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.29 
 
 
370 aa  346  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
374 aa  345  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.89 
 
 
374 aa  345  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.56 
 
 
380 aa  345  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
374 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>