More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24901 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_24901  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 372 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.76 
 
 		 372 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0267  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.76 
 
 		 372 aa  614  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03501  tRNA-guanine transglycosylase  73.92 
 
 		 376 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.92 
 
 		 376 aa  604  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.77 
 
 		 372 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02931  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.25 
 
 		 372 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0273  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.71 
 
 		 372 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02941  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.98 
 
 		 372 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.483841  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03041  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.9 
 
 		 372 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.67 
 
 		 384 aa  510  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.54 
 
 		 387 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.74 
 
 		 394 aa  504  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.19 
 
 		 381 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.27 
 
 		 367 aa  494  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.81 
 
 		 375 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.98 
 
 		 366 aa  481  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.98 
 
 		 366 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.67 
 
 		 380 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.39 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.57 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.13 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.89 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.89 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 		 384 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.23 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.44 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.87 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.87 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.99 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.15 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.02 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.31 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.85 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.17 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.03 
 
 		 336 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.02 
 
 		 372 aa  362  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.01 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.4 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.89 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.73 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.67 
 
 		 380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.7 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.48 
 
 		 371 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.88 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.15 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 		 388 aa  352  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.31 
 
 		 382 aa  352  7e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.29 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.33 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.05 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0983  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.88 
 
 		 381 aa  348  8e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.410572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.89 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.89 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.32 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 		 372 aa  346  4e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.96 
 
 		 380 aa  345  5e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.4 
 
 		 376 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.29 
 
 		 372 aa  344  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.95 
 
 		 370 aa  342  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 		 380 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.41 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07170  tRNA-guanine transglycosylase  46.58 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.934048 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.53 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.73 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.33 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.33 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.78 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0399  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.16 
 
 		 375 aa  339  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 		 391 aa  339  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.45 
 
 		 384 aa  338  7e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.13 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.13 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1052  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.9 
 
 		 377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.66 
 
 		 377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1091  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.9 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.6 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.19 
 
 		 383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.4 
 
 		 370 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.21 
 
 		 381 aa  335  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.99 
 
 		 374 aa  335  7.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>