More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02981 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
372 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.77 
 
 
372 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.24 
 
 
376 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03501  tRNA-guanine transglycosylase  70.97 
 
 
376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0267  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.77 
 
 
372 aa  577  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24901  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.77 
 
 
372 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02931  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.13 
 
 
372 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0273  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.13 
 
 
372 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03041  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.52 
 
 
372 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02941  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.05 
 
 
372 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.483841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.22 
 
 
387 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.66 
 
 
384 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.1 
 
 
375 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.78 
 
 
367 aa  470  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.42 
 
 
394 aa  465  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.77 
 
 
381 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.67 
 
 
366 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.67 
 
 
366 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 
370 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 
380 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 
380 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.35 
 
 
394 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.56 
 
 
379 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 
373 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 
379 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.56 
 
 
379 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.56 
 
 
379 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.65 
 
 
388 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
373 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.01 
 
 
372 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.29 
 
 
370 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
392 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
365 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.29 
 
 
379 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.65 
 
 
369 aa  368  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.7 
 
 
372 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.57 
 
 
374 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
383 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.81 
 
 
372 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 
373 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
369 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
357 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.71 
 
 
375 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
384 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.31 
 
 
367 aa  359  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.17 
 
 
369 aa  358  7e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.85 
 
 
382 aa  358  7e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.1 
 
 
392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
388 aa  355  6.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.72 
 
 
380 aa  353  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
379 aa  353  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.45 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.73 
 
 
392 aa  352  5e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.87 
 
 
370 aa  352  7e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.36 
 
 
395 aa  351  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.55 
 
 
392 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
380 aa  350  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.74 
 
 
367 aa  349  5e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.86 
 
 
372 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.21 
 
 
371 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.83 
 
 
370 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.38 
 
 
368 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
372 aa  346  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.3 
 
 
383 aa  345  7e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 
383 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.14 
 
 
385 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.01 
 
 
383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
373 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.86 
 
 
370 aa  342  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.84 
 
 
369 aa  342  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.92 
 
 
372 aa  342  5e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.48 
 
 
368 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.55 
 
 
374 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.79 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.73 
 
 
369 aa  342  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.67 
 
 
383 aa  342  9e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.84 
 
 
369 aa  342  9e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07170  tRNA-guanine transglycosylase  46.92 
 
 
382 aa  340  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.934048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
374 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.88 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.09 
 
 
376 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.63 
 
 
383 aa  339  5e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.69 
 
 
374 aa  339  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.13 
 
 
380 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.82 
 
 
375 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.15 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.28 
 
 
375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.21 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1789  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.39 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.57 
 
 
377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>