More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0455 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 384 aa  798    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.22 
 
 		 387 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.16 
 
 		 375 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.47 
 
 		 394 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.76 
 
 		 381 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.18 
 
 		 366 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.9 
 
 		 366 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.35 
 
 		 367 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.02 
 
 		 372 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24901  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.67 
 
 		 372 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0267  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.57 
 
 		 372 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03501  tRNA-guanine transglycosylase  61.05 
 
 		 376 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.93 
 
 		 376 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.66 
 
 		 372 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02931  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.55 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0273  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02941  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.28 
 
 		 372 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.483841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.59 
 
 		 380 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.04 
 
 		 380 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03041  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.28 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 		 379 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 		 379 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.25 
 
 		 379 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.25 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.25 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.25 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.25 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.25 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.25 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.25 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.42 
 
 		 379 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.78 
 
 		 370 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 375 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.93 
 
 		 357 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.63 
 
 		 372 aa  421  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.06 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.88 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 		 379 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.18 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 		 368 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.79 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.84 
 
 		 380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.59 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 		 382 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.68 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.5 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.96 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.5 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.24 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.23 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.23 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.43 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.03 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.22 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.84 
 
 		 368 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.44 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.26 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.26 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.88 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.83 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.9 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.05 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.99 
 
 		 368 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.99 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.94 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.2 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.63 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.44 
 
 		 369 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.01 
 
 		 384 aa  371  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.99 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 373 aa  368  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.32 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.88 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.64 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.08 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.43 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.35 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>